RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PFASO15067 1338 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYPNQ86TC9 1320 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SIP14410 1827 aa17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ESYT3A0FGR9 886 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA8IPA6NC78 632 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA8JA6NMD2 632 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OPA1O60313 960 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTPROQ16827 1216 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM71AQ8IYT1 594 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MCPH1Q8NEM0 835 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMC2Q8TDI7 906 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC20A1Q8WUM9 679 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MFSD14AQ96MC6 490 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIFC3Q9BVG8 833 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM8AQ9HCN3 771 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC9A2Q9UBY0 812 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD2APQ9Y5K6 639 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF541Q9H0D2 1346 aa17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA8KD6RF30 607 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HSF2BPO75031 334 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CAPN2P17655 700 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GTF2H1P32780 548 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACTN2P35609 894 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC39A4Q6P5W5 647 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IFT81Q8WYA0 676 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SAAL1Q96ER3 474 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COG5Q9UP83 839 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SSC5DA1L4H1 1573 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRIT1O00522 736 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SART1O43290 800 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPS6KA5O75582 802 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GZMAP12544 262 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCD1P33897 745 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPC3P51654 580 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MFAP3P55082 362 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CUL1Q13616 776 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GNPTABQ3T906 1256 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SWSAP1Q6NVH7 229 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABHD15Q6UXT9 468 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 USP37Q86T82 979 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EPS8L1Q8TE68 723 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SHC3Q92529 594 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KREMEN1Q96MU8 473 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CARD9Q9H257 536 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HOXC10Q9NYD6 342 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FZD1Q9UP38 647 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RTN2O75298 545 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM153BP0C7A2 387 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GARTP22102 1010 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACTR2P61160 394 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERVK-9P63128 1117 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPFIA1Q13136 1202 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM153CQ494X1 144 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C11orf63Q6NUN7 778 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEMA4DQ92854 862 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KAT5Q92993 513 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AP1M1Q9BXS5 423 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CYP26B1Q9NR63 512 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM153AQ9UHL3 310 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa17.81■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A0G2JMZ2 1700 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA6CA6NDK9 693 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 H0YCG3 227 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FTLP02792 175 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA6DP0CG33 693 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPC5P78333 572 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRKCEQ02156 737 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CYP24A1Q07973 514 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZSCAN26Q16670 478 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LEKR1Q6ZMV7 388 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IQCKQ8N0W5 287 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HELQQ8TDG4 1101 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNN1Q92952 543 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZIM3Q96PE6 472 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNG1Q9UIX4 513 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MTA2O94776 668 aa17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms