RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 POLD4Q9HCU8 107 aa8.6□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 TMEM161AQ9NX61 479 aa8.6□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 CFAP45Q9UL16 551 aa8.6□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 FRYLO94915 3013 aa8.6□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 KIAA1671Q9BY89 1806 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 A0A0U1RQF3 1178 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 LPXNO60711 386 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 HIP1RO75146 1068 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 ARHGEF15O94989 841 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 PLA2G4BP0C869 781 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 PLCG1P19174 1290 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 AXLP30530 894 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 CTNNB1P35222 781 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 NAMPTP43490 491 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 ME1P48163 572 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 RAB27AP51159 221 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 PTENP60484 403 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 POU5F1BQ06416 359 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 PKP1Q13835 747 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 DSC3Q14574 896 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
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SMG6-211ENST00000572369 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.59□□□□□ -1.03
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SMG6-211ENST00000572369 RRAGBQ5VZM2 374 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 NOTUMQ6P988 496 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 GPBP1Q86WP2 473 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 PGBD4Q96DM1 585 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 CPB2Q96IY4 423 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 EPSTI1Q96J88 318 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 CLIC6Q96NY7 704 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 TIPINQ9BVW5 301 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 MINDY3Q9H8M7 445 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.59□□□□□ -1.03
SMG6-211ENST00000572369 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.59□□□□□ -1.03
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SMG6-211ENST00000572369 SFI1A8K8P3 1242 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 K7ERI5 159 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 PPP6R2O75170 966 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 FAM13AO94988 1023 aa8.58□□□□□ -1.04
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SMG6-211ENST00000572369 PEX3P56589 373 aa8.58□□□□□ -1.04
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SMG6-211ENST00000572369 GPM6BQ13491 265 aa8.58□□□□□ -1.04
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SMG6-211ENST00000572369 MAPK6Q16659 721 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 EPC2Q52LR7 807 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 ATL3Q6DD88 541 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 SPRED2Q7Z698 418 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
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SMG6-211ENST00000572369 HACE1Q8IYU2 909 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 PDILTQ8N807 584 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 HELQQ8TDG4 1101 aa8.58□□□□□ -1.04
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SMG6-211ENST00000572369 GDPD5Q8WTR4 605 aa8.58□□□□□ -1.04
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SMG6-211ENST00000572369 NFKBIZQ9BYH8 718 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 PANK2Q9BZ23 570 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 CCSER1Q9C0I3 900 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 TMEM117Q9H0C3 514 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 AAASQ9NRG9 546 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 KCND2Q9NZV8 630 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 FAM50BQ9Y247 325 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.58□□□□□ -1.04
SMG6-211ENST00000572369 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
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