RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569224.1

DDX19B-215, Transcript of DEAD-box helicase 19B, human

TSL 2

Gene DDX19B, Length 707 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX19B-215	ENST00000569224	STRA6	Q9BX79	667 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	USP20	Q9Y2K6	914 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	LINC01553	A4QN01	128 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	N4BP3	O15049	544 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF202	O95125	648 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	EOMES	O95936	686 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	IDE	P14735	1019 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	GAP43	P17677	238 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	LIG1	P18858	919 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	PROZ	P22891	400 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	CASP1	P29466	404 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	AFM	P43652	599 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	GATM	P50440	423 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	ASIC1	P78348	528 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	GTF2B	Q00403	316 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	CUL4B	Q13620	913 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	UNC13D	Q70J99	1090 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	SPRED2	Q7Z698	418 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	PAGE5	Q96GU1	130 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	PANK4	Q9NVE7	773 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	TBX20	Q9UMR3	447 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	IPP	Q9Y573	584 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	INPPL1	O15357	1258 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	HOXA2	O43364	376 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	KLRC4	O43908	158 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	NPTXR	O95502	500 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	PIGR	P01833	764 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	MYL1	P05976	194 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	PRR29	P0C7W0	189 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	ABCD1	P33897	745 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	CASP5	P51878	434 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	TAP1	Q03518	808 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	STRN3	Q13033	797 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	ZPBP2	Q6X784	338 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	CNNM3	Q8NE01	707 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	LPP	Q93052	612 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	HVCN1	Q96D96	273 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	CASD1	Q96PB1	797 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	HES2	Q9Y543	173 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	OFD1	O75665	1012 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	ERVK-21	P61565	698 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	DPYD	Q12882	1025 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224		Q7L0L9	218 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	FIBCD1	Q8N539	461 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX19B-215	ENST00000569224	RNF169	Q8NCN4	708 aa		10.22	□□□□□ -0.77

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