RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 PLA2G4BP0C869 781 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 LTBRP36941 435 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 SLC12A3P55017 1021 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 HACE1Q8IYU2 909 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 CALML4Q96GE6 196 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 GBP3Q9H0R5 595 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 GIT1Q9Y2X7 761 aa23.56■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 ARL5CA6NH57 179 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 N4BP3O15049 544 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 B4GALT3O60512 393 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 DDHD2O94830 711 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 LIG1P18858 919 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 NPTX2P47972 431 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 PEX3P56589 373 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 ADAM15Q13444 863 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM169Q96HH4 297 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 GAD1Q99259 594 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 TCF25Q9BQ70 676 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 PDZD7Q9H5P4 517 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 KCND2Q9NZV8 630 aa23.55■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC169A6NNP5 214 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 H3BQ06 376 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 K7ERI5 159 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 POMCP01189 267 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 EDN1P05305 212 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 MLH1P40692 756 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 NRIP1P48552 1158 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 SLC11A1P49279 550 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 EFHBQ8N7U6 833 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 IGSF21Q96ID5 467 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 APOL6Q9BWW8 343 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 TLE6Q9H808 572 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 USP20Q9Y2K6 914 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.54■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 LINC01565O15544 149 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 ALDH2P05091 517 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 AKAP5P24588 427 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 TMC7Q7Z402 723 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 LRRC15Q8TF66 581 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 ZFP42Q96MM3 310 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 MIOSQ9NXC5 875 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 SFI1A8K8P3 1242 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 PLPP4Q5VZY2 271 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 GSTCDQ8NEC7 633 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 USP28Q96RU2 1077 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 ADPGKQ9BRR6 497 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 VCANP13611 3396 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.52■■□□□ 1.36
RNPS1-218ENST00000566180 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-218ENST00000566180 PER2O15055 1255 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-218ENST00000566180 TBX10O75333 385 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-218ENST00000566180 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-218ENST00000566180 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-218ENST00000566180 PLS3P13797 630 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-218ENST00000566180 PLCG1P19174 1290 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-218ENST00000566180 SCNN1GP51170 649 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-218ENST00000566180 DSC1Q08554 894 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-218ENST00000566180 SLC39A14Q15043 492 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-218ENST00000566180 DUSP6Q16828 381 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-218ENST00000566180 ARSHQ5FYA8 562 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-218ENST00000566180 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-218ENST00000566180 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
RNPS1-218ENST00000566180 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms