RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	NUDT11	Q96G61	164 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA25	Q9BR10	227 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	NTM	Q9P121	344 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	PXDN	Q92626	1479 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ITSN1	Q15811	1721 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	LPL	P06858	475 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	PDGFRB	P09619	1106 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	AMPH	P49418	695 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ANTXR2	P58335	489 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	FAP	Q12884	760 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	MOGS	Q13724	837 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CARF	Q8N187	725 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	FERMT2	Q96AC1	680 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ADAMTS20	P59510	1910 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	USP19	O94966	1318 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF10	O15013	1369 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	SH3D21	A4FU49	640 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	PCDH8	O95206	1070 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CFP	P27918	469 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	HOXC9	P31274	260 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CAP1	Q01518	475 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	IP6K1	Q92551	441 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CFAP53	Q96M91	514 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	USP18	Q9UMW8	372 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	EDAR	Q9UNE0	448 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	MYPN	Q86TC9	1320 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	KIF1A	Q12756	1690 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	INSR	P06213	1382 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	GABRD	O14764	452 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	KLHL18	O94889	574 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	MT-CO1	P00395	513 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CHGB	P05060	677 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	MYBL2	P10244	700 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	GPR3	P46089	330 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	KCNQ1	P51787	676 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	BCAR1	P56945	870 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	NFATC3	Q12968	1075 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	UGT8	Q16880	541 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	MTG2	Q9H4K7	406 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	PIK3C2A	O00443	1686 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	TNKS	O95271	1327 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA0232	Q92628	1395 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0G2JNJ9	132 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934		K7ESF4	209 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	STAT5B	P51692	787 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	SLURP1	P55000	103 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	INAVA	Q3KP66	663 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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