RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.15□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 MFSD5Q6N075 450 aa4.15□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 KIAA1841Q6NSI8 718 aa4.15□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 CMTM4Q8IZR5 234 aa4.15□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 UIMC1Q96RL1 719 aa4.15□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 SOX7Q9BT81 388 aa4.15□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 SERHL2Q9H4I8 314 aa4.15□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ZMAT4Q9H898 229 aa4.15□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa4.15□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa4.15□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 FAM83GA6ND36 823 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 LPXNO60711 386 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 MFAP3LO75121 409 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 NPEPPSP55786 919 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 NHLH1Q02575 133 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 SPIDRQ14159 915 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 FAM214AQ32MH5 1076 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC144BQ3MJ40 725 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ZZZ3Q8IYH5 903 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 CHTF18Q8WVB6 975 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ORAI3Q9BRQ5 295 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 IFT57Q9NWB7 429 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ING3Q9NXR8 418 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 CD2APQ9Y5K6 639 aa4.14□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 MAFGO15525 162 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 MTSS1O43312 755 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 GAS7O60861 476 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 IPO13O94829 963 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 PCDH8O95206 1070 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 F2P00734 622 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 CFBP00751 764 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 GAAP10253 952 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 HK1P19367 917 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 NEK4P51957 841 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 DSG1Q02413 1049 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 MAN2A1Q16706 1144 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ST8SIA2Q92186 375 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 OSBPL6Q9BZF3 934 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 WDR11Q9BZH6 1224 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 MTFR1LQ9H019 292 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 PIF1Q9H611 641 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 SORCS3Q9UPU3 1222 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 MYPNQ86TC9 1320 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.13□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 TGM5O43548 720 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ALDH1A2O94788 518 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 FSBPO95073 299 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 LAG3P18627 525 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 GNAT2P19087 354 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 CD40P25942 277 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 CD69Q07108 199 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 FOXI1Q12951 378 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 TCEA2Q15560 299 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 CNNM4Q6P4Q7 775 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 KIF18BQ86Y91 864 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 EFHBQ8N7U6 833 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 MS4A5Q9H3V2 200 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 MSRAQ9UJ68 235 aa4.12□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 LCHNA4D1U4 455 aa4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 MATN4O95460 622 aa4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 CXCR5P32302 372 aa4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 PTTG1IPP53801 180 aa4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 SEC24CP53992 1094 aa4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 LRRC32Q14392 662 aa4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 TKFCQ3LXA3 575 aa4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 LRRTM3Q86VH5 581 aa4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 PASD1Q8IV76 773 aa4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 UNC5BQ8IZJ1 945 aa4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ENKD1Q9H0I2 346 aa4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
FAM227B-211ENST00000560557 USP18Q9UMW8 372 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms