RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 PWWP2AQ96N64 755 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 KCNC2Q96PR1 638 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 B3GNT5Q9BYG0 378 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM60Q9H2L4 133 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 Q9UFV3 132 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 ANO9A1A5B4 782 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 PMM2O15305 246 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 TRIM13O60858 407 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 CYP7B1O75881 506 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 HRGP04196 525 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF28P17035 718 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 CTSSP25774 331 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 IL12RB1P42701 662 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 ETV4P43268 484 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 PICALMQ13492 652 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 MST1LQ2TV78 715 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 EXOC8Q8IYI6 725 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 LINC01356Q8N9X3 169 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 FAM156AQ8NDB6 213 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 RGMAQ96B86 450 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 WDR92Q96MX6 357 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 CGRRF1Q99675 332 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 LRFN3Q9BTN0 628 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 OSBPL6Q9BZF3 934 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 USP25Q9UHP3 1055 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 SGTAO43765 313 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 PRAMEF4O60810 478 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 SASH1O94885 1247 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 KLHL18O94889 574 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 FSBPO95073 299 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 FTLP02792 175 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 HMGCRP04035 888 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 GAAP10253 952 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 HOXA5P20719 270 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 HTR1BP28222 390 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 POLD1P28340 1107 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 SLC6A9P48067 706 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 KCNQ1P51787 676 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 MAP2K6P52564 334 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 DSC2Q02487 901 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 NOMO1Q15155 1222 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 LLGL1Q15334 1064 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 GORABQ5T7V8 394 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 SWSAP1Q6NVH7 229 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 ABHD15Q6UXT9 468 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 CCDC149Q6ZUS6 474 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 SP8Q8IXZ3 490 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 GPR156Q8NFN8 814 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF480Q8WV37 535 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 RAB24Q969Q5 203 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 C7orf25Q9BPX7 421 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 MYH16Q9H6N6 1097 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 COMMD10Q9Y6G5 202 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 AKR1B10O60218 316 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 ENDOD1O94919 500 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 LDHAP00338 332 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 SLC5A1P13866 664 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 ECHS1P30084 290 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 CTSWP56202 376 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 FAM193AP78312 1265 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 CDC42EP1Q00587 391 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 SEMA5AQ13591 1074 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 MAN2A1Q16706 1144 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 ANO6Q4KMQ2 910 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 NPNTQ6UXI9 565 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 Q6ZVL8 140 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 CERS3Q8IU89 383 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 IFNL2Q8IZJ0 200 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 FNIP1Q8TF40 1166 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 SNX33Q8WV41 574 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 NUDT11Q96G61 164 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 SAMD11Q96NU1 681 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-205ENST00000558714 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms