RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	TNFRSF25	Q93038	417 aa		15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	BTBD18	B2RXH4	712 aa		15.46	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	OFD1	O75665	1012 aa		15.46	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	NTHL1	P78549	312 aa		15.46	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	SPEM2	Q0P670	501 aa		15.46	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	HTR4	Q13639	388 aa		15.46	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	15.46	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	PARM1	Q6UWI2	310 aa		15.46	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	FGF14	Q92915	247 aa		15.46	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		15.46	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	COL1A2	P08123	1366 aa		15.46	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	TMEM150B	A6NC51	233 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	FAM86B1	E9PN63	330 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	TEX28	O15482	410 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	MAFG	O15525	162 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	EDIL3	O43854	480 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	CYP3A4	P08684	503 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	LAMP2	P13473	410 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	PHKA2	P46019	1235 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	GPC3	P51654	580 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	BECN1	Q14457	450 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	CEP55	Q53EZ4	464 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	PALB2	Q86YC2	1186 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	TBCK	Q8TEA7	893 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	SCLT1	Q96NL6	688 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		15.45	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	MEIS1	O00470	390 aa		15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	LAMTOR5	O43504	91 aa		15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	GDF9	O60383	454 aa		15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	PDC	P20941	246 aa		15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	USP11	P51784	963 aa		15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	STARD6	P59095	220 aa		15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	RTKN	Q9BST9	563 aa		15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		15.44	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	FAM205C	A6NFA0	338 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	FAM170B	A6NMN3	283 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	ANHX	E9PGG2	379 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222		H3BQV1	296 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	ZNF862	O60290	1169 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	POMC	P01189	267 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	CIITA	P33076	1130 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	SLC26A2	P50443	739 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	UGCG	Q16739	394 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	NLRP7	Q8WX94	980 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	GJA10	Q969M2	543 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	MARCH5	Q9NX47	278 aa		15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	SYT1	P21579	422 aa		15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	HOXC13	P31276	330 aa		15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	LMNB2	Q03252	620 aa		15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	GIT2	Q14161	759 aa		15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	INF2	Q27J81	1249 aa		15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	KSR1	Q8IVT5	923 aa		15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	RABGGTA	Q92696	567 aa		15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	PIDD1	Q9HB75	910 aa		15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		15.42	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	PATJ	Q8NI35	1801 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		15.41	■□□□□ 0.06
CS-231	ENST00000552222	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		15.41	■□□□□ 0.06

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