RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 IFNL1Q8IU54 200 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM199Q8N511 208 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 STKLD1Q8NE28 680 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 HSPH1Q92598 858 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PLIN2Q99541 437 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MAP3K14Q99558 947 aa6.71□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
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PTPRB-210ENST00000551525 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CBFA2T3O75081 653 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TXKP42681 527 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 YAF2Q8IY57 180 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DDI1Q8WTU0 396 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RAPGEF5Q92565 580 aa6.71□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 N4BP3O15049 544 aa6.71□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM206Q9H813 350 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PIDD1Q9HB75 910 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 NTSR2O95665 410 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 TCF3P15923 654 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 BDNFP23560 247 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SCNN1BP51168 640 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 BPIFB4P59827 614 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 RELL1Q8IUW5 271 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TPH2Q8IWU9 490 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PHLPP1O60346 1717 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 UNCXA6NJT0 531 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEB2O15479 319 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TNNC1P63316 161 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 IRF5Q13568 498 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 LAMC2Q13753 1193 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 NFE2L1Q14494 772 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 VEPH1Q14D04 833 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 GEN1Q17RS7 908 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 IER5Q5VY09 327 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CABP7Q86V35 215 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MDM1Q8TC05 714 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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PTPRB-210ENST00000551525 C8orf48Q96LL4 319 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 NYAP2Q9P242 653 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 WDR19Q8NEZ3 1342 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 E7EWF7 191 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TXNDC9O14530 226 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EXOC3O60645 756 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CLUP10909 449 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EEF2P13639 858 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 NFIAQ12857 509 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CEP19Q96LK0 163 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PARVAQ9NVD7 372 aa6.7□□□□□ -1.34
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