RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 CNNM3Q8NE01 707 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 IFT74Q96LB3 600 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 ZFP42Q96MM3 310 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 GAD1Q99259 594 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 APOL6Q9BWW8 343 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 GBP3Q9H0R5 595 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 IGFLR1Q9H665 355 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 CLDND1Q9NY35 253 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 ARL5CA6NH57 179 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 ACKR2O00590 384 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 TBX10O75333 385 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 POMCP01189 267 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 GALTP07902 379 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 PLA2G4BP0C869 781 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 LIG1P18858 919 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 GUCY2CP25092 1073 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 LONP1P36776 959 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 MLH1P40692 756 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 NRIP1P48552 1158 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 PEX3P56589 373 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 ARSHQ5FYA8 562 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 USP28Q96RU2 1077 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 MIOSQ9NXC5 875 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 SFI1A8K8P3 1242 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 AKAP5P24588 427 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 UBA7P41226 1012 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 SPECC1Q5M775 1068 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 PLPP4Q5VZY2 271 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 GSTCDQ8NEC7 633 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 URGCPQ8TCY9 931 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 TCF25Q9BQ70 676 aa23.03■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
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CS-222ENST00000550996 PER2O15055 1255 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 SLC26A4O43511 780 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 GLP2RO95838 553 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 PLCG1P19174 1290 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 SCNN1GP51170 649 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 EFNA5P52803 228 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 ADAM15Q13444 863 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 VN1R2Q8NFZ6 395 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 IGSF21Q96ID5 467 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 EPSTI1Q96J88 318 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 DRC1Q96MC2 740 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 CLIC6Q96NY7 704 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-222ENST00000550996 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 C5orf42Q9H799 3197 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 CCDC169A6NNP5 214 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 N4BP3O15049 544 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 NCK2O43639 380 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 KRT17Q04695 432 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 EFHBQ8N7U6 833 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 KLK14Q9P0G3 267 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 GIT1Q9Y2X7 761 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 DSC1Q08554 894 aa23■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 CLUL1Q15846 466 aa23■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 DUSP6Q16828 381 aa23■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 CALML4Q96GE6 196 aa23■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 TIPINQ9BVW5 301 aa23■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 TLE6Q9H808 572 aa23■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa23■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 CLEC1BQ9P126 229 aa23■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 KANSL3Q9P2N6 904 aa23■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 F8W810 466 aa22.99■■□□□ 1.27
CS-222ENST00000550996 SLC16A4O15374 487 aa22.99■■□□□ 1.27
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