RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 CALML4Q96GE6 196 aa27.58■■■□□ 2.01
TM7SF3-212ENST00000543088 ADPGKQ9BRR6 497 aa27.58■■■□□ 2.01
TM7SF3-212ENST00000543088 GIT1Q9Y2X7 761 aa27.58■■■□□ 2.01
TM7SF3-212ENST00000543088 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa27.58■■■□□ 2.01
TM7SF3-212ENST00000543088 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa27.58■■■□□ 2.01
TM7SF3-212ENST00000543088 ACKR2O00590 384 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 LIG1P18858 919 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 NDUFV1P49821 464 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 TMC7Q7Z402 723 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 KCNK18Q7Z418 384 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM175Q9BSA9 504 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 APOL6Q9BWW8 343 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 CCDC113Q9H0I3 377 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 C17orf75Q9HAS0 396 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 KCND2Q9NZV8 630 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 STK39Q9UEW8 545 aa27.57■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 HIP1RO75146 1068 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 SRGAP2BP0DMP2 458 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP27.56■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 MLH1P40692 756 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 ADAM15Q13444 863 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 RINT1Q6NUQ1 792 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 RASSF8Q8NHQ8 419 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 PNMA5Q96PV4 448 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 RUSC1Q9BVN2 902 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 HES2Q9Y543 173 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa27.56■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 ARL5CA6NH57 179 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 CCDC169A6NNP5 214 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 INPPL1O15357 1258 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 POMCP01189 267 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 GALTP07902 379 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 GUCY2CP25092 1073 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 PEX3P56589 373 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 RESTQ13127 1097 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM119Q4V9L6 283 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 C1orf186Q6ZWK4 172 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 IGSF21Q96ID5 467 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 GAD1Q99259 594 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 KIFC3Q9BVG8 833 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 DNAJB4Q9UDY4 337 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 KCNG1Q9UIX4 513 aa27.55■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 STX6O43752 255 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 TBX10O75333 385 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 LTBRP36941 435 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC11A1P49279 550 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF280BQ86YH2 543 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 PLIN2Q99541 437 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 RNF39Q9H2S5 420 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 PDZD7Q9H5P4 517 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 POLD4Q9HCU8 107 aa27.54■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 GRXCR2A6NFK2 248 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 K7ERI5 159 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 LINC01565O15544 149 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 NR1I2O75469 434 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 ALDH2P05091 517 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 PLA2G4BP0C869 781 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 NPTX2P47972 431 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 DUSP6Q16828 381 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 RPS6KC1Q96S38 1066 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 KMT5AQ9NQR1 393 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 PARP2Q9UGN5 583 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 CD207Q9UJ71 328 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 MTMR6Q9Y217 621 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 FAN1Q9Y2M0 1017 aa27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 DDHD2O94830 711 aa27.52■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 CA8P35219 290 aa27.52■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 SCNN1GP51170 649 aa27.52■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 GIT2Q14161 759 aa27.52■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 DAW1Q8N136 415 aa27.52■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 VPS52Q8N1B4 723 aa27.52■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 CLIC4Q9Y696 253 aa27.52■■■□□ 2
TM7SF3-212ENST00000543088 PER2O15055 1255 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-212ENST00000543088 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-212ENST00000543088 AKAP5P24588 427 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-212ENST00000543088 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC12A3P55017 1021 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-212ENST00000543088 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM87AQ8NBN3 555 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-212ENST00000543088 ZFP42Q96MM3 310 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM134Q9H6X4 195 aa27.51■■□□□ 1.99
TM7SF3-212ENST00000543088 IL9P15248 144 aa27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms