RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIFC3Q9BVG8 833 aa17.83■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PDZD7Q9H5P4 517 aa17.83■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRDM6Q9NQX0 595 aa17.83■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRIP11Q15643 1979 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 K7ERI5 159 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EDN1P05305 212 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLS3P13797 630 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DNAJB1P25685 340 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STK38Q15208 465 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LONRF3Q496Y0 759 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARSHQ5FYA8 562 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC39A11Q8N1S5 342 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HLA-CQ95604 372 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADPGKQ9BRR6 497 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POLD4Q9HCU8 107 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KMT5AQ9NQR1 393 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TLR9Q9NR96 1032 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GIT1Q9Y2X7 761 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC169A6NNP5 214 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPTLC2O15270 562 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NCK2O43639 380 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NPTXRO95502 500 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCP2P22307 547 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DDIT3P35638 169 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF131P52739 623 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BCAR1P56945 870 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PKP1Q13835 747 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AAK1Q2M2I8 961 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TCEAL5Q5H9L2 206 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 USP49Q70CQ1 688 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GPBP1Q86WP2 473 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPP2R3CQ969Q6 453 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLIC6Q96NY7 704 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 REEP2Q9BRK0 252 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM175Q9BSA9 504 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPG21Q9NZD8 308 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TCHHQ07283 1943 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARL5CA6NH57 179 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TTLL13PA6NNM8 815 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 H0YCG3 227 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MLH1P40692 756 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMTNP53814 917 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KRT17Q04695 432 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MCM6Q14566 821 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM132AQ24JP5 1023 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPECC1Q5M775 1068 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATF7IP2Q5U623 682 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNFSF13BQ9Y275 285 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HES2Q9Y543 173 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A0C4DFX4 3053 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FSD2A1L4K1 749 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FSCN2O14926 492 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PBX3P40426 434 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NCKAP1LP55160 1127 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TJAP1Q5JTD0 557 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NT5DC1Q5TFE4 455 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TAS1R3Q7RTX0 852 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCNG4Q8TDN1 519 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ASB2Q96Q27 587 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GAD1Q99259 594 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RNF39Q9H2S5 420 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STK39Q9UEW8 545 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SFI1A8K8P3 1242 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC16A4O15374 487 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CUTAO60888 179 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DDHD2O94830 711 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BRD1O95696 1058 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GALTP07902 379 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LIG1P18858 919 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABCD1P33897 745 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IRS1P35568 1242 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DSC1Q08554 894 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GIT2Q14161 759 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BECN1Q14457 450 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms