RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540486.5

TRAPPC1-202, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC1, Length 759 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-202ENST00000540486 RING1Q06587 406 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 ST3GAL1Q11201 340 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 SEMA3FQ13275 785 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 NUDT18Q6ZVK8 323 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC26A6Q9BXS9 759 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 RIC8AQ9NPQ8 531 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 DENND4AQ7Z401 1863 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 FAM170BA6NMN3 283 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 ANHXE9PGG2 379 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 hCG_1984214I3L0E3 225 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 GDF9O60383 454 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 FDPSP14324 419 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 MARK3P27448 753 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 RPS9P46781 194 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 CLK2P49760 499 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 NAPAP54920 295 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 SP4Q02446 784 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 UBE2SQ16763 222 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 FEZF2Q8TBJ5 459 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 CLDN23Q96B33 292 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 TBC1D32Q96NH3 1257 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 AIFM3Q96NN9 605 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 MYADMQ96S97 322 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZMYND12Q9H0C1 365 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 STK39Q9UEW8 545 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 DPP7Q9UHL4 492 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 PCDHA6Q9UN73 950 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 TELO2Q9Y4R8 837 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 FRMPD4Q14CM0 1322 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 MAST4O15021 2626 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 CPLX1O14810 134 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 LAMP2P13473 410 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 KLRC2P26717 231 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 CLCN4P51793 760 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 PPP2R5DQ14738 602 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 UBXN2BQ14CS0 331 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC44A4Q53GD3 710 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 RSPH1Q8WYR4 309 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 CUL5Q93034 780 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 RNF19AQ9NV58 838 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 CLUHO75153 1309 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 ESYT2A0FGR8 921 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 EDIL3O43854 480 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 DEXIO95424 95 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 BCAR1P56945 870 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 GPC5P78333 572 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 MMRN1Q13201 1228 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 HTR4Q13639 388 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 DSC3Q14574 896 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 RABEP1Q15276 862 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 NPY5RQ15761 445 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 TSSK4Q6SA08 328 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 NLRX1Q86UT6 975 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 GTF3C6Q969F1 213 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 CDHR1Q96JP9 859 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 PGBD1Q96JS3 809 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 LTB4R2Q9NPC1 389 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 GINS2Q9Y248 185 aa9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 IGF2RP11717 2491 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 SMAPO00193 183 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 JAK2O60674 1132 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 KCNK5O95279 499 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 ITGB5P18084 799 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 ADCY7P51828 1080 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAPPC1-202ENST00000540486 PFKPQ01813 784 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms