RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 KSR2Q6VAB6 950 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-214ENST00000530727 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-214ENST00000530727 KLHL36Q8N4N3 616 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-214ENST00000530727 BOCQ9BWV1 1114 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-214ENST00000530727 CABP5Q9NP86 173 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-214ENST00000530727 INCENPQ9NQS7 918 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-214ENST00000530727 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-214ENST00000530727 INTUQ9ULD6 942 aa5.1□□□□□ -1.59
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PTPRC-214ENST00000530727 TTC21AQ8NDW8 1320 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-214ENST00000530727 POLKQ9UBT6 870 aa5.09□□□□□ -1.6
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PTPRC-214ENST00000530727 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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PTPRC-214ENST00000530727 COG3Q96JB2 828 aa5.07□□□□□ -1.6
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