RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529955.5

BBS1-218, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene BBS1, Length 3,437 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-218ENST00000529955 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 KIF13BQ9NQT8 1826 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 CHUKO15111 745 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 SART1O43290 800 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ZBED4O75132 1171 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 QARSP47897 775 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 SMTNP53814 917 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 BFSP1Q12934 665 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 C11orf91Q3C1V1 193 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 RGMBQ6NW40 437 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 PARD3BQ8TEW8 1205 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 APEX2Q9UBZ4 518 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ATRNL1Q5VV63 1379 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 SLC16A4O15374 487 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 KRT14P02533 472 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 PRKCIP41743 596 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 IFFO1Q0D2I5 559 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 NNTQ13423 1086 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 SPDYE2Q495Y8 402 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 CBWD6Q4V339 395 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 CBWD3Q5JTY5 395 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 CBWD5Q5RIA9 395 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ARHGEF16Q5VV41 709 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 SLC35G2Q8TBE7 412 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 BICD1Q96G01 975 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ZIM3Q96PE6 472 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.657e-7■□□□□ 9.9
BBS1-218ENST00000529955 A0A1B0GUA9 196 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 FGGP02679 453 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 FAM153BP0C7A2 387 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 HPDP32754 393 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 VAMP7P51809 220 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 FAM153CQ494X1 144 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 NEK9Q8TD19 979 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 WHAMMQ8TF30 809 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ARL8AQ96BM9 186 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 LRRC45Q96CN5 670 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 OSGEPQ9NPF4 335 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 KCND2Q9NZV8 630 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 FAM153AQ9UHL3 310 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 FRMPD4Q14CM0 1322 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 F8VZ95 297 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 SORBS3O60504 671 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ITGB5P18084 799 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ANXA13P27216 316 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 HAUS6Q7Z4H7 955 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 SH2D3CQ8N5H7 860 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 XXYLT1Q8NBI6 393 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 RMDN3Q96TC7 470 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 AMACRQ9UHK6 382 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ZHX2Q9Y6X8 837 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 TISP43B9A030 160 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 AGPSO00116 658 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ICAM1P05362 532 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 MXI1P50539 228 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 NLRX1Q86UT6 975 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 RFFLQ8WZ73 363 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ETAA1Q9NY74 926 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 SCN9AQ15858 1988 aa10.98□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 MUTP22033 750 aa10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 TRADDQ15628 312 aa10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 TKFCQ3LXA3 575 aa10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 WDR78Q5VTH9 848 aa10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 TAAR1Q96RJ0 339 aa10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 IWS1Q96ST2 819 aa10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 CBWD1Q9BRT8 395 aa10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 SIX2Q9NPC8 291 aa10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 EXOC7Q9UPT5 735 aa10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 TMEM150BA6NC51 233 aa10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 CCDC188H7C350 402 aa10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 YWHABP31946 246 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 CDR1P51861 262 aa10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 NPEPPSP55786 919 aa10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 MESDQ14696 234 aa10.97□□□□□ -0.65
BBS1-218ENST00000529955 ARMC2Q8NEN0 867 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms