RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 ALPK3Q96L96 1907 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 NBNO60934 754 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 CXCL10P02778 98 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 FGFR4P22455 802 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 PMS1P54277 932 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 PAK2Q13177 524 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 MYBPC2Q14324 1141 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC51Q96ER9 411 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 MED15Q96RN5 788 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 CALUO43852 315 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 GARTP22102 1010 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ADSSP30520 456 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 CD52P31358 61 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF165P49910 485 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD40Q6AI12 368 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 NOTUMQ6P988 496 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 IKZF4Q9H2S9 585 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TSPY26PQ9H489 355 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 CTNND2Q9UQB3 1225 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ABLIM1O14639 778 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 RAG1P15918 1043 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 MCL1Q07820 350 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 MFSD5Q6N075 450 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TSG101Q99816 390 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 TRAIPQ9BWF2 469 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 USP20Q9Y2K6 914 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A0B4J269 797 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 N4BP3O15049 544 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 CLDN3O15551 220 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 ITGB8P26012 769 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 CCL23P55773 120 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 APBB2Q92870 758 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 DMAC2Q9NW81 257 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 TISP43B9A030 160 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 EVI5O60447 810 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 SCLYQ96I15 445 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 FTHL17Q9BXU8 183 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM49BA6NDI0 452 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 IKBKBO14920 756 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 RPL13P26373 211 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 DSC3Q14574 896 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 CPB2Q96IY4 423 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 TMX1Q9H3N1 280 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 NR3C1P04150 777 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 MCF2P10911 925 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 STX17P56962 302 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 MYL5Q02045 173 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 SPATA1Q5VX52 437 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 C7orf61Q8IZ16 206 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM199Q8N511 208 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 SEPT8Q92599 483 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 TCHPQ9BT92 498 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 PFKMP08237 780 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 NR2F2P24468 414 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 IQCB1Q15051 598 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 VWCEQ96DN2 955 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 CDT1Q9H211 546 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM189A1O60320 539 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 ADAM9Q13443 819 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXL18Q96ME1 805 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 CEP63Q96MT8 703 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 CBX8Q9HC52 389 aa24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3-205ENST00000528462 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.03■■□□□ 1.44
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