RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 E9PMD0 336 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 ACKR2O00590 384 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 B4GALT5O43286 388 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 CDC25AP30304 524 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.856e-7■■■■■ 38.6
TSPAN4-216ENST00000526055 NDUFV1P49821 464 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 GIT2Q14161 759 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 SNX21Q969T3 373 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 IGSF21Q96ID5 467 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 KCND2Q9NZV8 630 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 CD207Q9UJ71 328 aa20.36■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 ARL5CA6NH57 179 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 TBX10O75333 385 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 ALDH2P05091 517 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 PRKCBP05771 671 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 GUCY2CP25092 1073 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 COASYQ13057 564 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 IRAK3Q9Y616 596 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 LINC01565O15544 149 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 NPTXRO95502 500 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 SYT1P21579 422 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC11A1P49279 550 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 KCNK18Q7Z418 384 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 PNMA5Q96PV4 448 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 GAD1Q99259 594 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 GBP3Q9H0R5 595 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 RNF39Q9H2S5 420 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 HES2Q9Y543 173 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 HIP1RO75146 1068 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 NR1I2O75469 434 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 DDHD2O94830 711 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 GLP2RO95838 553 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 POMCP01189 267 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 CTSAP10619 480 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 IL9P15248 144 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 MLH1P40692 756 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 UBA7P41226 1012 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 DSC1Q08554 894 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 CABP7Q86V35 215 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 VPS52Q8N1B4 723 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 CALML4Q96GE6 196 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 ZBP1Q9H171 429 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 CLEC1BQ9P126 229 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 K7ERI5 159 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 PER2O15055 1255 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 MBTPS2O43462 519 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 KCNC3Q14003 757 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 DAW1Q8N136 415 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 HIDE1A8MVS5 230 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 NRP1O14786 923 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 B4GALT3O60512 393 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 NPTX2P47972 431 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC12A3P55017 1021 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPAN4-216ENST00000526055 PEX3P56589 373 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms