RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523702.5

CPS1-211, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CPS1, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-211ENST00000523702 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.18□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 REPS2Q8NFH8 660 aa7.18□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.18□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 HDAC10Q969S8 669 aa7.18□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.18□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 LDAHQ9H6V9 325 aa7.18□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.18□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 UBXN7O94888 489 aa7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 TSPAN15O95858 294 aa7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 ADCY7P51828 1080 aa7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 ADAM8P78325 824 aa7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 AGBL4Q5VU57 503 aa7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 STON2Q8WXE9 905 aa7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 CGRRF1Q99675 332 aa7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 ADAMTS20P59510 1910 aa7.17□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 TUSC2O75896 110 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 TOX4O94842 621 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 AMY1AP04745 511 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 SYN1P17600 705 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 MAP2K6P52564 334 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 SLURP1P55000 103 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 HGFACQ04756 655 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 RNF151Q2KHN1 245 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 MST1LQ2TV78 715 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 USP30Q70CQ3 517 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 SLC39A13Q96H72 371 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 SLC38A3Q99624 504 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 OR10A2Q9H208 303 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 H3BML4 177 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 APAF1O14727 1248 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 SREBF1P36956 1147 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 RAP1GAPP47736 663 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 GPHA2Q96T91 129 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 SARGQ9BW04 601 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 FAM50BQ9Y247 325 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-211ENST00000523702 MROH6A6NGR9 719 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 C9orf118A6NHY6 69 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 RFXAPO00287 272 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 MATN2O00339 956 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 B3GALT2O43825 422 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 B4GALT4O60513 344 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PEX14O75381 377 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 MYL1P05976 194 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 TRIM27P14373 513 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 CASRP41180 1078 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 BPIFB4P59827 614 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 NPNTQ6UXI9 565 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 MIGA2Q7L4E1 593 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 DENND1CQ8IV53 801 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 CFHR4Q92496 578 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 GPRC5DQ9NZD1 345 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 ZMYM3Q14202 1370 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-211ENST00000523702 TPP1O14773 563 aa7.13□□□□□ -1.27
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