RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 UBA7P41226 1012 aa15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 NRIP1P48552 1158 aa15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC11A1P49279 550 aa15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC12A3P55017 1021 aa15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 PEX3P56589 373 aa15.56■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
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PDGFRB-202ENST00000517488 SLC27A1Q6PCB7 646 aa15.56■□□□□ 0.08
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PDGFRB-202ENST00000517488 TMEM169Q96HH4 297 aa15.54■□□□□ 0.08
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PDGFRB-202ENST00000517488 DRC1Q96MC2 740 aa15.54■□□□□ 0.08
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PDGFRB-202ENST00000517488 USP28Q96RU2 1077 aa15.54■□□□□ 0.08
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PDGFRB-202ENST00000517488 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa15.54■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 KLK14Q9P0G3 267 aa15.54■□□□□ 0.08
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PDGFRB-202ENST00000517488 EPSTI1Q96J88 318 aa15.53■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 TIPINQ9BVW5 301 aa15.53■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 VN1R3Q9BXE9 311 aa15.53■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa15.53■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 PARP2Q9UGN5 583 aa15.53■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 GRXCR2A6NFK2 248 aa15.52■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 NRP1O14786 923 aa15.52■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC16A4O15374 487 aa15.52■□□□□ 0.08
PDGFRB-202ENST00000517488 GLP2RO95838 553 aa15.52■□□□□ 0.08
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