RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 PGM2L1Q6PCE3 622 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF480Q8WV37 535 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 SSH1Q8WYL5 1049 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC2A13Q96QE2 648 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 TCF25Q9BQ70 676 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 GREM2Q9H772 168 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 MKS1Q9NXB0 559 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 NCDNQ9UBB6 729 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRPS1Q9UHF7 1281 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 RCAN3Q9UKA8 241 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-410P-201ENST00000517006 ITGA10O75578 1167 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 PDGFRBP09619 1106 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 GYPEP15421 78 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 MCAMP43121 646 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 DUSP2Q05923 314 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 CLUL1Q15846 466 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 PTPN21Q16825 1174 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM214AQ32MH5 1076 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPATS1Q496A3 300 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 MUM1L1Q5H9M0 696 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM111BQ6SJ93 734 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 Q6ZVL8 140 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 GPR156Q8NFN8 814 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 FATE1Q969F0 183 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 TEKT5Q96M29 485 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 KLC2Q9H0B6 622 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 GPRC5DQ9NZD1 345 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 RPTORQ8N122 1335 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 WNT10BO00744 389 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRRG2O14669 202 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 NDUFS2O75306 463 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 NPEPPSP55786 919 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 MGAT2Q10469 447 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 ODF1Q14990 250 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 SEPT2Q15019 361 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 D2HGDHQ8N465 521 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 CHST13Q8NET6 341 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 EDAQ92838 391 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 IL17RAQ96F46 866 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 KLHL33A6NCF5 533 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 AKR1B10O60218 316 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 PHF2O75151 1096 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 CRHR1P34998 444 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC6A9P48067 706 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 NEK2P51955 445 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 ACAP2Q15057 778 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 FKBP15Q5T1M5 1219 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 C1QL3Q5VWW1 255 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 PALM2Q8IXS6 379 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 OR5M3Q8NGP4 307 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 ARL8AQ96BM9 186 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 CHMP4CQ96CF2 233 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 BORCS6Q96GS4 357 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADOQ96SZ5 270 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 MPHOSPH9Q99550 1183 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 SERPINB13Q9UIV8 391 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 SIK3Q9Y2K2 1263 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZMYM3Q14202 1370 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 CAPN14A8MX76 684 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 MUSKO15146 869 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 GASTP01350 101 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 ECHS1P30084 290 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 SREBF1P36956 1147 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 WASP42768 502 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 GZMKP49863 264 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 NOMO1Q15155 1222 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 MFSD14BQ5SR56 506 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM240Q5SV17 173 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPM1NQ8N819 430 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 REPS2Q8NFH8 660 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 OR7D4Q8NG98 312 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 MDM1Q8TC05 714 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 NRG4Q8WWG1 115 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-410P-201ENST00000517006 CEP95Q96GE4 821 aa4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms