RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516146.1

RNU6-27P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 27, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-27P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-27P-201ENST00000516146 ADGRF1Q5T601 910 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 RSPH3Q86UC2 560 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 FAM129CQ86XR2 697 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 TICAM2Q86XR7 235 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 TEX19Q8NA77 164 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 SLC35A4Q96G79 324 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 DYDC2Q96IM9 177 aa4.56□□□□□ -1.68
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RNU6-27P-201ENST00000516146 ARMT1Q9H993 441 aa4.56□□□□□ -1.68
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RNU6-27P-201ENST00000516146 TERF2IPQ9NYB0 399 aa4.56□□□□□ -1.68
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RNU6-27P-201ENST00000516146 CR1LQ2VPA4 569 aa4.55□□□□□ -1.68
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RNU6-27P-201ENST00000516146 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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RNU6-27P-201ENST00000516146 CD300LDQ6UXZ3 194 aa4.55□□□□□ -1.68
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RNU6-27P-201ENST00000516146 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.55□□□□□ -1.68
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RNU6-27P-201ENST00000516146 ABHD4Q8TB40 342 aa4.55□□□□□ -1.68
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RNU6-27P-201ENST00000516146 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.55□□□□□ -1.68
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RNU6-27P-201ENST00000516146 SUCLG2Q96I99 432 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 OSBPL6Q9BZF3 934 aa4.55□□□□□ -1.68
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RNU6-27P-201ENST00000516146 PCDH18Q9HCL0 1135 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 PNPOQ9NVS9 261 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 FBXO10Q9UK96 956 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 POM121BA6NF01 834 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 ADAMTS3O15072 1205 aa4.54□□□□□ -1.68
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RNU6-27P-201ENST00000516146 BRAFP15056 766 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 CTSSP25774 331 aa4.54□□□□□ -1.68
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RNU6-27P-201ENST00000516146 CHKAP35790 457 aa4.54□□□□□ -1.68
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RNU6-27P-201ENST00000516146 MAPK10P53779 464 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 IL13RA1P78552 427 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 RASSF7Q02833 373 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 ZNF543Q08ER8 600 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 BLMHQ13867 455 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 DAG1Q14118 895 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 STARD3Q14849 445 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 WDR78Q5VTH9 848 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 CCDC174Q6PII3 467 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-27P-201ENST00000516146 GPR155Q7Z3F1 870 aa4.54□□□□□ -1.68
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RNU6-27P-201ENST00000516146 IL31RAQ8NI17 732 aa4.54□□□□□ -1.68
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