RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	MARCH5	Q9NX47	278 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	HES2	Q9Y543	173 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG4-208	ENST00000514110	ARL5C	A6NH57	179 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110		F8W810	466 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	NEMF	O60524	1076 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	DGAT1	O75907	488 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	BRD1	O95696	1058 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	ASGR2	P07307	311 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	GLRA2	P23416	452 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	AXL	P30530	894 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	MLH1	P40692	756 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	CLCN4	P51793	760 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	NEK4	P51957	841 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	TFDP1	Q14186	410 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	AMHR2	Q16671	573 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	CABP7	Q86V35	215 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	GAD1	Q99259	594 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	POTEM	A6NI47	508 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	C2CD2L	O14523	706 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	INPPL1	O15357	1258 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	B4GALT5	O43286	388 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	EFEMP2	O95967	443 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	KLRC2	P26717	231 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	AVPR2	P30518	371 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	OR1G1	P47890	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	RARRES1	P49788	294 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	SCNN1G	P51170	649 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	DSC1	Q08554	894 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	TCF15	Q12870	199 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	TRIM29	Q14134	588 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	SEC24B	O95487	1268 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	SOD2	P04179	222 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	MCM7	P33993	719 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	PTPN5	P54829	565 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	MTMR3	Q13615	1198 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	GPR149	Q86SP6	731 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	MED24	O75448	989 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	NPTXR	O95502	500 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	UROD	P06132	367 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	AKAP5	P24588	427 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	PRRX2	Q99811	253 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	UST	Q9Y2C2	406 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	PIEZO1	Q92508	2521 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNHG4-208	ENST00000514110	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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