RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1841Q6NSI8 718 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 NOTUMQ6P988 496 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 TMC5Q6UXY8 1006 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 CABP7Q86V35 215 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 FEZF2Q8TBJ5 459 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 PIGOQ8TEQ8 1089 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 MTMR9Q96QG7 549 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 GAD1Q99259 594 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 CSRNP2Q9H175 543 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 UBN1Q9NPG3 1134 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 STK39Q9UEW8 545 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 HES2Q9Y543 173 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 ARL5CA6NH57 179 aa18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 LILRB3O75022 631 aa18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 GLRA2P23416 452 aa18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 KLRC2P26717 231 aa18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 MLH1P40692 756 aa18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 RARRES1P49788 294 aa18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 VCPP55072 806 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 POU5F1BQ06416 359 aa18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 COLGALT2Q8IYK4 626 aa18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 CCDC51Q96ER9 411 aa18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 APOL6Q9BWW8 343 aa18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 MARCH5Q9NX47 278 aa18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 MIOSQ9NXC5 875 aa18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 SORCS3Q9UPU3 1222 aa18.81■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 POTEMA6NI47 508 aa18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 C2CD2LO14523 706 aa18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 BRD1O95696 1058 aa18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 ATP2B1P20020 1258 aa18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 OR1G1P47890 313 aa18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 CLCN4P51793 760 aa18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 ST3GAL1Q11201 340 aa18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 AMHR2Q16671 573 aa18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 TAS1R1Q7RTX1 841 aa18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 ZFP42Q96MM3 310 aa18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 TMEM60Q9H2L4 133 aa18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 SFXN1Q9H9B4 322 aa18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 LIMD1Q9UGP4 676 aa18.8■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 WDFY4Q6ZS81 3184 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 INPPL1O15357 1258 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 B4GALT5O43286 388 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 SOD2P04179 222 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 URODP06132 367 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 ASGR2P07307 311 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 AVPR2P30518 371 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 SCNN1GP51170 649 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 PTPN5P54829 565 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 MTMR3Q13615 1198 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 MAEAQ7L5Y9 396 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 GPR149Q86SP6 731 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 UBALD2Q8IYN6 164 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 PRRX2Q99811 253 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 SMOC2Q9H3U7 446 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 USTQ9Y2C2 406 aa18.79■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 USO1O60763 962 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa18.78■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 MCM7P33993 719 aa18.78■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 GUCY1B3Q02153 619 aa18.78■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 DSC1Q08554 894 aa18.78■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 TCF15Q12870 199 aa18.78■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 RPS6KC1Q96S38 1066 aa18.78■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 PHOX2BQ99453 314 aa18.78■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa18.78■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.78■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 KMT2EQ8IZD2 1858 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 PIEZO1Q92508 2521 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 F8W810 466 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 SEC24BO95487 1268 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 NPTXRO95502 500 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 EFEMP2O95967 443 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 AKAP5P24588 427 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 CATSPER3Q86XQ3 398 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 HACE1Q8IYU2 909 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 GIT1Q9Y2X7 761 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 A0A1B0GUA9 196 aa18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 LRRIQ4A6NIV6 560 aa18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 TEX28O15482 410 aa18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 MED24O75448 989 aa18.76■□□□□ 0.59
HERC3-211ENST00000513325 NR1I2O75469 434 aa18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms