RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM67Q6ZTA4 783 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 CATSPER3Q86XQ3 398 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 HACE1Q8IYU2 909 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 POMKQ9H5K3 350 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 NR2E1Q9Y466 385 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 HES2Q9Y543 173 aa27.37■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 ARL5CA6NH57 179 aa27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 NRP1O14786 923 aa27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 EPCAMP16422 314 aa27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
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ALYREF-203ENST00000511412 PPFIBP1Q86W92 1011 aa27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 FAM184AQ8NB25 1140 aa27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 MCPH1Q8NEM0 835 aa27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 ERMNQ8TAM6 284 aa27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 RIPOR3Q96MK2 946 aa27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 GAD1Q99259 594 aa27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 APOL6Q9BWW8 343 aa27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 RNF39Q9H2S5 420 aa27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 GPRC5CQ9NQ84 441 aa27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM221A6NGB7 291 aa27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 LRRIQ4A6NIV6 560 aa27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 M0R296 226 aa27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 B4GALT5O43286 388 aa27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 MTHFRP42898 656 aa27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF174Q15697 407 aa27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 PTPN21Q16825 1174 aa27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 COLGALT2Q8IYK4 626 aa27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 SLC22A17Q8WUG5 538 aa27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 NACC1Q96RE7 527 aa27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 KCNH6Q9H252 994 aa27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 MARCH5Q9NX47 278 aa27.35■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 OR1G1P47890 313 aa27.34■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 SCNN1GP51170 649 aa27.34■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 TTC38Q5R3I4 469 aa27.34■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 KIAA1841Q6NSI8 718 aa27.34■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 SLC27A1Q6PCB7 646 aa27.34■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 POTEGQ6S5H5 508 aa27.34■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa27.34■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 CABP7Q86V35 215 aa27.34■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa27.34■■□□□ 1.97
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ALYREF-203ENST00000511412 URODP06132 367 aa27.33■■□□□ 1.97
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ALYREF-203ENST00000511412 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
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ALYREF-203ENST00000511412 SIGLEC14Q08ET2 396 aa27.33■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 HAUS3Q68CZ6 603 aa27.33■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 ZBTB33Q86T24 672 aa27.33■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 NOSTRINQ8IVI9 506 aa27.33■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa27.33■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 ZFP42Q96MM3 310 aa27.33■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 KLHL5Q96PQ7 755 aa27.33■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
ALYREF-203ENST00000511412 TRIOO75962 3097 aa27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 SPDYE4A6NLX3 237 aa27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 NPTXRO95502 500 aa27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 WEE2P0C1S8 567 aa27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 KLRC2P26717 231 aa27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 TRAPPC10P48553 1259 aa27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 PRIMPOLQ96LW4 560 aa27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 KIF2CQ99661 725 aa27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 SFXN1Q9H9B4 322 aa27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF318Q5VUA4 2279 aa27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 DENND4AQ7Z401 1863 aa27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGEF35A5YM69 484 aa27.31■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 NR1I2O75469 434 aa27.31■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 CNPP09543 421 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 CLCN4P51793 760 aa27.31■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 C8orf34Q49A92 452 aa27.31■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 PBXIP1Q96AQ6 731 aa27.31■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 FBXL18Q96ME1 805 aa27.31■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa27.31■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 MUC6Q6W4X9 2439 aa27.3■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 A0A1B0GUA9 196 aa27.3■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 C2CD4DB7Z1M9 353 aa27.3■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 C2CD2LO14523 706 aa27.3■■□□□ 1.96
ALYREF-203ENST00000511412 AKAP5P24588 427 aa27.3■■□□□ 1.96
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