RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507253.5

PITX1-206, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-206ENST00000507253 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.06■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 TMEM134Q9H6X4 195 aa26.06■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 TLR9Q9NR96 1032 aa26.06■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 ODF2LQ9ULJ1 636 aa26.06■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 GIT1Q9Y2X7 761 aa26.06■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 CSPG5O95196 566 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 F13A1P00488 732 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 SMTNP53814 917 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 BCAR1P56945 870 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 RAD54LQ92698 747 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 PDZD7Q9H5P4 517 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 STK17AQ9UEE5 414 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 INPPL1O15357 1258 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 YEATS4O95619 227 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 PLS3P13797 630 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 DNAJB1P25685 340 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 CAMK1Q14012 370 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 GPBP1Q86WP2 473 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 SLC39A11Q8N1S5 342 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 SPIRE2Q8WWL2 714 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 TMEM169Q96HH4 297 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 EPSTI1Q96J88 318 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 ASB2Q96Q27 587 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 APOL6Q9BWW8 343 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 HES2Q9Y543 173 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 H0YCG3 227 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 PBX3P40426 434 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 SPECC1Q5M775 1068 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 CLIC6Q96NY7 704 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 GBP3Q9H0R5 595 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 ARL5CA6NH57 179 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 SPTLC2O15270 562 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 PPP6R2O75170 966 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 KRT18P05783 430 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 MLH1P40692 756 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 MCM6Q14566 821 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 ATF7IP2Q5U623 682 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 ATL3Q6DD88 541 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 GAD1Q99259 594 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 TMEM175Q9BSA9 504 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PITX1-206ENST00000507253 FSD2A1L4K1 749 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 SFI1A8K8P3 1242 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 POMCP01189 267 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 SCP2P22307 547 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 DDIT3P35638 169 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 STRN3Q13033 797 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 BECN1Q14457 450 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 ARSHQ5FYA8 562 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 RRAGBQ5VZM2 374 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 USP49Q70CQ1 688 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 RPS6KC1Q96S38 1066 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 REEP2Q9BRK0 252 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 RNF39Q9H2S5 420 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 STK39Q9UEW8 545 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 PARP2Q9UGN5 583 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 UNC80Q8N2C7 3258 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 TTLL13PA6NNM8 815 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 SLC16A4O15374 487 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 TBCAO75347 108 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 FAM13AO94988 1023 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 GALTP07902 379 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 IRS1P35568 1242 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 TFF2Q03403 129 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 TNFSF13BQ9Y275 285 aa26■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.99■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 EDN1P05305 212 aa25.99■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 AKAP5P24588 427 aa25.99■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 HYAL1Q12794 435 aa25.99■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 COL19A1Q14993 1142 aa25.99■■□□□ 1.75
PITX1-206ENST00000507253 NT5DC1Q5TFE4 455 aa25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms