RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 BACH1O14867 736 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 XYLBO75191 536 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 PMLP29590 882 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 APOBRQ0VD83 1088 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 TFDP1Q14186 410 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 EPHA7Q15375 998 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 CSRP2Q16527 193 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 CYP2W1Q8TAV3 490 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 CSRNP2Q9H175 543 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-210ENST00000503258 MSH4O15457 936 aa8.65□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 SLC26A4O43511 780 aa8.65□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.65□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 C11orf74Q86VG3 221 aa8.65□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 SIX5Q8N196 739 aa8.65□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 AKT3Q9Y243 479 aa8.65□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 NOTCH4Q99466 2003 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 NRP1O14786 923 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 KLRC2P26717 231 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF76P36508 570 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 PTENP60484 403 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 FZD5Q13467 585 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 NOTUMQ6P988 496 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 FGFR3P22607 806 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 FSHRP23945 695 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 DPP6P42658 865 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 CCR3P51677 355 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 NTRK3Q16288 839 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 AMHR2Q16671 573 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 DGKKQ5KSL6 1271 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 OTUD6AQ7L8S5 288 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 MTRRQ9UBK8 725 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 VAV3Q9UKW4 847 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 PI15O43692 258 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 IGHDP01880 384 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 VTNP04004 478 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 ARL2P36404 184 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC32Q14392 662 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM266Q2M3C6 531 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 TSC2P49815 1807 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 LAMA3Q16787 3333 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 TEX28O15482 410 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 ITGA4P13612 1032 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 TPGS2Q68CL5 300 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 VWA8A3KMH1 1905 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF197O14709 1029 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 N4BP3O15049 544 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 DDHD2O94830 711 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 CLCN3P51790 818 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 FERMT3Q86UX7 667 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 NLRP7Q8WX94 980 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 TM4SF5O14894 197 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 LAMTOR5O43504 91 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 GAS7O60861 476 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 EPN2O95208 641 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 PLD1Q13393 1074 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 NAB2Q15742 525 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 MIER3Q7Z3K6 550 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-210ENST00000503258 PHKBQ93100 1093 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms