RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	WEE2	P0C1S8	567 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SMARCA1	P28370	1054 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF76	P36508	570 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNC3	Q14003	757 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	TEAD4	Q15561	434 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SMC5	Q8IY18	1101 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K14	Q99558	947 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	IL25	Q9H293	177 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	NFASC	O94856	1347 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	DKK1	O94907	266 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	RXRA	P19793	462 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	RFX1	P22670	979 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	NUCB1	Q02818	461 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM228A	Q86W67	206 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SCLT1	Q96NL6	688 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF302	Q9NR11	478 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	STK17A	Q9UEE5	414 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCL14	O95715	111 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	VTN	P04004	478 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CALM1	P0DP23	149 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CALM2	P0DP24	149 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CALM3	P0DP25	149 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	AR	P10275	920 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CLCN5	P51795	746 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PTH1R	Q03431	593 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP55	Q53EZ4	464 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM169	Q96HH4	297 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PGBD1	Q96JS3	809 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CASD1	Q96PB1	797 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	LY9	Q9HBG7	655 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	AKT3	Q9Y243	479 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	USP3	Q9Y6I4	520 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	COL1A2	P08123	1366 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM186A	A6NE01	2351 aa		12.27	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SFI1	A8K8P3	1242 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	PRC1	O43663	620 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	NAPA	P54920	295 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ANTXR2	P58335	489 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	TMTC2	Q8N394	836 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP7D2	Q96T17	732 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	RUBCNL	Q9H714	662 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	NOS2	P35228	1153 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM189B	P81408	668 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	AAMP	Q13685	434 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CABP7	Q86V35	215 aa		12.26	□□□□□ -0.45

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