RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493026.2

PSMD11-205, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 11, human

TSL 2

Gene PSMD11, Length 2,387 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD11-205	ENST00000493026	NAA35	Q5VZE5	725 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	FIZ1	Q96SL8	496 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	P4HA2	O15460	535 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	PAEP	P09466	180 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	HSPA6	P17066	643 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	GBP1	P32455	592 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	PRELP	P51888	382 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	GUCY1A3	Q02108	690 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	TCP10	Q12799	353 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	ALCAM	Q13740	583 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	KIF22	Q14807	665 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	NEK9	Q8TD19	979 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	MASTL	Q96GX5	879 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	PFAS	O15067	1338 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	FAM187A	A6NFU0	413 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	ENPP3	O14638	875 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	DRP2	Q13474	957 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	NLRP14	Q86W24	1093 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	OGFOD1	Q8N543	542 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	AMACR	Q9UHK6	382 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	PPFIA2	O75334	1257 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	FSBP	O95073	299 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	PLS1	Q14651	629 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	RINL	Q6ZS11	566 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	DAPK3	O43293	454 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	PLA2G6	O60733	806 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	STAT2	P52630	851 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	ICE2	Q659A1	982 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	GJB7	Q6PEY0	223 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	TPH2	Q8IWU9	490 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	MYO1F	O00160	1098 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	PMM2	O15305	246 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	GAS7	O60861	476 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	FGG	P02679	453 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	BCR	P11274	1271 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	ITGA4	P13612	1032 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	TNFAIP3	P21580	790 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	USP8	P40818	1118 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	CDR1	P51861	262 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	MYL7	Q01449	175 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	CETN1	Q12798	172 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	CEP55	Q53EZ4	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	CROCCP2	Q86T23	111 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSMD11-205	ENST00000493026	JAML	Q86YT9	394 aa		13.74	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms