RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 CDH7Q9ULB5 785 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 RAB23Q9ULC3 237 aa15.59■□□□□ 0.09
ATG4B-222ENST00000491867 SMCO2A6NFE2 343 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 WDR64B1ANS9 1081 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 TARSP26639 723 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 CDC42EP1Q00587 391 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 DSG1Q02413 1049 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 UGCGQ16739 394 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 RSAD1Q9HA92 442 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 WDR81Q562E7 1941 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 SGSM2O43147 1006 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 EFEMP2O95967 443 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 CYP3A4P08684 503 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 OR1G1P47890 313 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 NTHL1P78549 312 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 SETQ01105 290 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 PFKPQ01813 784 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 MTAPQ13126 283 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 LAIR1Q6GTX8 287 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 MTSS1LQ765P7 747 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 MICU3Q86XE3 530 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 CRYGNQ8WXF5 182 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 B3GALT6Q96L58 329 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 KXD1Q9BQD3 176 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 MTA3Q9BTC8 594 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 DISC1Q9NRI5 854 aa15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 F8W810 466 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 ZMYND10O75800 440 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 C1RP00736 705 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 RPL17P18621 184 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 MCM5P33992 734 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 LIFRP42702 1097 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 RPS9P46781 194 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 DNM2P50570 870 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 PRR16Q569H4 304 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 LILRA6Q6PI73 481 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF410Q86VK4 478 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 RHPN2Q8IUC4 686 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 KSR1Q8IVT5 923 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 COLGALT2Q8IYK4 626 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 FGF13Q92913 245 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM87BQ96K49 555 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 NELL2Q99435 816 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 GLT8D2Q9H1C3 349 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa15.56■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 NCAM2O15394 837 aa15.55■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 GDF9O60383 454 aa15.55■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 LRP3O75074 770 aa15.55■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 RETP07949 1114 aa15.55■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 MTERF2Q49AM1 385 aa15.55■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 PRR23BQ6ZRT6 265 aa15.55■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 MAP4K1Q92918 833 aa15.55■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 NLRP4Q96MN2 994 aa15.55■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 CHST7Q9NS84 486 aa15.55■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 SEMA4GQ9NTN9 838 aa15.55■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa15.55■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 BARHL2Q9NY43 387 aa15.55■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 V9GY48 417 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM150BA6NC51 233 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 TDGF1P13385 188 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 PMLP29590 882 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 FZD5Q13467 585 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF852Q6ZMS4 543 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 PRR23CQ6ZRP0 262 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 ITFG1Q8TB96 612 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 CEP89Q96ST8 783 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 SH2D3AQ9BRG2 576 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 LRRC2Q9BYS8 371 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 FNIP2Q9P278 1114 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 LAMA1P25391 3075 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 NBEAQ8NFP9 2946 aa15.54■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 ADAMTS3O15072 1205 aa15.53■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 CHMP2AO43633 222 aa15.53■□□□□ 0.08
ATG4B-222ENST00000491867 NRLP54845 237 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms