RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACADVLP49748 655 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYLK3Q32MK0 819 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FIGNQ5HY92 759 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 HGSNATQ68CP4 663 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 RRAGAQ7L523 313 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TAOK1Q7L7X3 1001 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPP4R1Q8TF05 950 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 HAUS7Q99871 368 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PITPNM3Q9BZ71 974 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNK9Q9NPC2 374 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHD4Q14839 1912 aa7.36□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 RASGRF2O14827 1237 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAPK13O15264 365 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MGEA5O60502 916 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FUCA1P04066 466 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPN1P04843 607 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FGFR4P22455 802 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOXD10P28358 340 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOXD13P35453 343 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MOGSQ13724 837 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 E2F2Q14209 437 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 RILPL1Q5EBL4 403 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAPH1Q70E73 1250 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANO5Q75V66 913 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM47Q96LD4 638 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYL10Q9BUA6 226 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CPDO75976 1380 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANPEPP15144 967 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLTPP55058 493 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNIP1Q15025 636 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACAP1Q15027 740 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPS6KA1Q15418 735 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 LONRF1Q17RB8 773 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TTI2Q6NXR4 508 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 C11orf74Q86VG3 221 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MICU3Q86XE3 530 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 METTL13Q8N6R0 699 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 STMN2Q93045 179 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ERGIC2Q96RQ1 377 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MRC1P22897 1456 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CES2O00748 559 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 KDM1AO60341 852 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 LDHCP07864 332 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 COPB2P35606 906 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 EXOC3L4Q17RC7 722 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 BAP1Q92560 729 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKS1AQ92625 1134 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAGEB18Q96M61 343 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM109Q9BVC6 243 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CABP5Q9NP86 173 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.35□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.34□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.34□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.34□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNFRSF10AO00220 468 aa7.34□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNA2P16389 499 aa7.34□□□□□ -1.23
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms