RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 ADAMTS20P59510 1910 aa7.21□□□□□ -1.25
CTDSPL-208ENST00000486978 MAGEB2O15479 319 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC37A4O43826 429 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF862O60290 1169 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 JAK2O60674 1132 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 C22orf31O95567 290 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 OATP04181 439 aa7.21□□□□□ -1.26
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CTDSPL-208ENST00000486978 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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CTDSPL-208ENST00000486978 TMC7Q7Z402 723 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.21□□□□□ -1.26
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CTDSPL-208ENST00000486978 SLC22A17Q8WUG5 538 aa7.21□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 NELL1Q92832 810 aa7.21□□□□□ -1.26
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CTDSPL-208ENST00000486978 EPC1Q9H2F5 836 aa7.21□□□□□ -1.26
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CTDSPL-208ENST00000486978 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.21□□□□□ -1.26
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CTDSPL-208ENST00000486978 WDR81Q562E7 1941 aa7.21□□□□□ -1.26
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CTDSPL-208ENST00000486978 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa7.2□□□□□ -1.26
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CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.2□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 XKR3Q5GH77 459 aa7.2□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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CTDSPL-208ENST00000486978 HAS1Q92839 578 aa7.2□□□□□ -1.26
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CTDSPL-208ENST00000486978 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.2□□□□□ -1.26
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CTDSPL-208ENST00000486978 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.2□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.2□□□□□ -1.26
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CTDSPL-208ENST00000486978 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 BTBD18B2RXH4 712 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 TAF4O00268 1085 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 EML1O00423 815 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 SPTLC1O15269 473 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 MARCH6O60337 910 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR32O75388 356 aa7.19□□□□□ -1.26
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CTDSPL-208ENST00000486978 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 CXCL14O95715 111 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 VTNP04004 478 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 STAG3L1P0CL83 205 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 CD72P21854 359 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 PSMC5P62195 406 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 RABEP1Q15276 862 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC6Q16204 474 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 KIZQ2M2Z5 673 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDSPL-208ENST00000486978 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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