RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 N4BP3O15049 544 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 SLC16A4O15374 487 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 GIT2Q14161 759 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 PANK2Q9BZ23 570 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 STK17AQ9UEE5 414 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-211ENST00000480301 TRANK1O15050 2925 aa23.08■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 MYO7AQ13402 2215 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 A0A087X0B3 334 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 FGF18O76093 207 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 PBX3P40426 434 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 ZNF558Q96NG5 402 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 INPPL1O15357 1258 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 CUTAO60888 179 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 ZNF131P52739 623 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 TIGD5Q53EQ6 642 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 SHC4Q6S5L8 630 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.287e-13■■■■□ 19.9
ACTB-211ENST00000480301 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 POF1BQ8WVV4 589 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 APOL6Q9BWW8 343 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 CFAP45Q9UL16 551 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 EYSQ5T1H1 3165 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 B4GALT3O60512 393 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 AKAP5P24588 427 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 SMTNP53814 917 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 BCAR1P56945 870 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 PLCB3Q01970 1234 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 URGCPQ8TCY9 931 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 GAD1Q99259 594 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 MIOSQ9NXC5 875 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 TNFSF13BQ9Y275 285 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 GIT1Q9Y2X7 761 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 ARL5CA6NH57 179 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 DDHD2O94830 711 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 POMCP01189 267 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 KRT18P05783 430 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 MAPTP10636 758 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 IRS1P35568 1242 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 MLH1P40692 756 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 NCKAP1LP55160 1127 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 UBE3AQ05086 875 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 HACE1Q8IYU2 909 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 MYCT1Q8N699 235 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 KCNN1Q92952 543 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 ZFP42Q96MM3 310 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 PARVGQ9HBI0 331 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 PTPRHQ9HD43 1115 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 SPG21Q9NZD8 308 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 FAM13AO94988 1023 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 GALTP07902 379 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 PPM1AP35813 382 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 STAT6P42226 847 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 SV2BQ7L1I2 683 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 PDILTQ8N807 584 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 GSTCDQ8NEC7 633 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 FIZ1Q96SL8 496 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 ADPGKQ9BRR6 497 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 GBP3Q9H0R5 595 aa23.03■■□□□ 1.28
ACTB-211ENST00000480301 SNTG2Q9NY99 539 aa23.03■■□□□ 1.28
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