RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473460.1

GINS1-202, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene GINS1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-202ENST00000473460 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 LRRC32Q14392 662 aa4.94□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.94□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 CFAP100Q494V2 611 aa4.94□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 STRIP1Q5VSL9 837 aa4.94□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 NXPE1Q8N323 547 aa4.94□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.94□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 COX11Q9Y6N1 276 aa4.94□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 A0A1W2PR48 441 aa4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 LCHNA4D1U4 455 aa4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 ZNF185O15231 689 aa4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 CD40P25942 277 aa4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 FLT3P36888 993 aa4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 USP14P54578 494 aa4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 DSG1Q02413 1049 aa4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 FOXI1Q12951 378 aa4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 SOGA3Q5TF21 947 aa4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 EFHBQ8N7U6 833 aa4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 CHTF18Q8WVB6 975 aa4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 WDR26Q9H7D7 661 aa4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 USP18Q9UMW8 372 aa4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 GAGE12BA1L429 117 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 RFPL3O75679 317 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 NDUFA10O95299 355 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 F2P00734 622 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 BMPR1AP36894 532 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 NHLH2Q02577 135 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 DUSP2Q05923 314 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 ANKS6Q68DC2 871 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 RD3Q7Z3Z2 195 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 SUPT20HQ8NEM7 779 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 ADAM2Q99965 735 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 OSBPL2Q9H1P3 480 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 MS4A5Q9H3V2 200 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 MSRAQ9UJ68 235 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 PRSS38A1L453 326 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 SEC24CP53992 1094 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 KRTAP10-11P60412 298 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 PRR16Q569H4 304 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 METRNLQ641Q3 311 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 KIF18BQ86Y91 864 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 LCORLQ8N3X6 602 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 GAB3Q8WWW8 586 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 COQ10AQ96MF6 247 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 HDAC5Q9UQL6 1122 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 ZMYM3Q14202 1370 aa4.91□□□□□ -1.62
GINS1-202ENST00000473460 PIPSLA2A3N6 862 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 UNC119BA6NIH7 251 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 MARCH11A6NNE9 402 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 DIRC3C9JPN6 131 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 CD38P28907 300 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 PTH2RP49190 550 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 GPR15P49685 360 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 MGAT5Q09328 741 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 FERMT2Q96AC1 680 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 NEU1Q99519 415 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 MTFR1LQ9H019 292 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 TMEM260Q9NX78 707 aa4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa4.89□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa4.89□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 KPNA6O60684 536 aa4.89□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 ASMTLO95671 621 aa4.89□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 AVPR1BP47901 424 aa4.89□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 APBA1Q02410 837 aa4.89□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 TP53BP2Q13625 1128 aa4.89□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 UBE3CQ15386 1083 aa4.89□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 CCDC178Q5BJE1 867 aa4.89□□□□□ -1.63
GINS1-202ENST00000473460 GPR158Q5T848 1215 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms