RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 MAPK13O15264 365 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 TREHO43280 583 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 KRT13P13646 458 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 GPD1LQ8N335 351 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 C7orf31Q8N865 590 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 FAM213AQ9BRX8 229 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 NUP58Q9BVL2 599 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 NFKBIZQ9BYH8 718 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 TMX1Q9H3N1 280 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 TRIM17Q9Y577 477 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 INHAP05111 366 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 TPM1P09493 284 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 CYP2C9P11712 490 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 PHKA2P46019 1235 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 VAMP7P51809 220 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM62Q0P6H9 643 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 ZPBP2Q6X784 338 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 KLHDC9Q8NEP7 349 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 BEGAINQ9BUH8 593 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 CAPN11Q9UMQ6 739 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 DNAH12Q6ZR08 3092 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 BRCA2P51587 3418 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 B4GALT5O43286 388 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 MSNP26038 577 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 GPC3P51654 580 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 APBA1Q02410 837 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 KCNA10Q16322 511 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 SLFN12LQ6IEE8 588 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 NLRP7Q8WX94 980 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 ACKR2O00590 384 aa29.95■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 ZEB2O60315 1214 aa29.95■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 KRT9P35527 623 aa29.95■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP29.95■■■□□ 2.392e-7■■□□□ 14.4
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM139Q8IV31 216 aa29.95■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 CNGA4Q8IV77 575 aa29.95■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa29.95■■■□□ 2.39
HOXB3-207ENST00000472863 A0A0B4J269 797 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 C17orf102A2RUQ5 167 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 ASGR1P07306 291 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 HSPA6P17066 643 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 FMO5P49326 533 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 NBPF20Q3BBV1 942 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 CBWD6Q4V339 395 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 CBWD3Q5JTY5 395 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 CBWD5Q5RIA9 395 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 C1orf220Q5T0J3 134 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 SLAIN1Q8ND83 568 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 GRK4P32298 578 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 ACOT2P49753 483 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 KIZQ2M2Z5 673 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 FIGNQ5HY92 759 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 DNAJB3Q8WWF6 145 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 CCDC127Q96BQ5 260 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 MFSD14AQ96MC6 490 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 SCLT1Q96NL6 688 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 PANX2Q96RD6 677 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 MSTO1Q9BUK6 570 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 CLDN3O15551 220 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 EXTL3O43909 919 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 TOM1L1O75674 476 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 SLC9A1P19634 815 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 HOXC8P31273 242 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 PRMT2P55345 433 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 ZBTB33Q86T24 672 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 TCHPQ9BT92 498 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 ABHD10Q9NUJ1 306 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 PPP3CAQ08209 521 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 NEK11Q8NG66 645 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 KIAA1524Q8TCG1 905 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 ADAMTS10Q9H324 1103 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 GINS2Q9Y248 185 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 NOL4O94818 638 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 HARSP12081 509 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 CYP24A1Q07973 514 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 EXOC3L4Q17RC7 722 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 SEZ6Q53EL9 994 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 PARD3BQ8TEW8 1205 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 CDHR5Q9HBB8 845 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF233A6NK53 670 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXB3-207ENST00000472863 ABLIM1O14639 778 aa29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms