RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467065.1

UBXN4-205, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN4, Length 334 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-205ENST00000467065 SPECC1Q5M775 1068 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 SLC24A5Q71RS6 500 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 ANO5Q75V66 913 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 C4orf19Q8IY42 314 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 RNF169Q8NCN4 708 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 MCPH1Q8NEM0 835 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 DRC1Q96MC2 740 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 PLIN2Q99541 437 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 A0A087WZ62 844 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 A0A1B0GVL5 298 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 DGAT1O75907 488 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 SLITRK3O94933 977 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 FAM13AO94988 1023 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF202O95125 648 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 EYA4O95677 639 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 PLA2G4BP0C869 781 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 IDEP14735 1019 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 DARSP14868 501 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 IL9P15248 144 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 SCP2P22307 547 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 MCM4P33991 863 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 IRS1P35568 1242 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 PTPAQ15257 358 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 RESP18Q5W5W9 173 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 CLEC17AQ6ZS10 378 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 RHPN2Q8IUC4 686 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 KSR1Q8IVT5 923 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 C4orf32Q8N8J7 132 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 EPSTI1Q96J88 318 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 NLRP4Q96MN2 994 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 HSD17B14Q9BPX1 270 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 PLVAPQ9BX97 442 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 LMAN2LQ9H0V9 348 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 TNMDQ9H2S6 317 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 RNF19AQ9NV58 838 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 TMEM161AQ9NX61 479 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 CLDND1Q9NY35 253 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 RGL1Q9NZL6 768 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 DACH1Q9UI36 760 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 PLXNA3P51805 1871 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 TRIOO75962 3097 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 CCDC169A6NNP5 214 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 ZBTB39O15060 712 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 LINC01565O15544 149 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 TBX10O75333 385 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 LYPLA2O95372 231 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 SLFN14P0C7P3 912 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 PFKFB1P16118 471 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 PLCG1P19174 1290 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 CDC25AP30304 524 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 PBX3P40426 434 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 AFMP43652 599 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 ASIC1P78348 528 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 FAM189BP81408 668 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 HYAL1Q12794 435 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 STRN3Q13033 797 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 CAMK1Q14012 370 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 EMC2Q15006 297 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 CLUL1Q15846 466 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN4-205ENST00000467065 LEXMQ3ZCV2 418 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms