RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466185.1

PRPF4B-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF4B, Length 1,297 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-204ENST00000466185 NUDCQ9Y266 331 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 APAF1O14727 1248 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 LPLP06858 475 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 CCDC184Q52MB2 194 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 LILRA6Q6PI73 481 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 TTC17Q96AE7 1141 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 DNM3Q9UQ16 869 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 ASB1Q9Y576 335 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 MEGF6O75095 1541 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 ANO9A1A5B4 782 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 CCER2I3L3R5 266 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 SRGAP3O43295 1099 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 PRNPP04156 253 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 POU2F2P09086 479 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 DBHP09172 617 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 MTHFD2P13995 350 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 IL2RBP14784 551 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 FAHP16930 419 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 ERVFC1P60507 584 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 PICALMQ13492 652 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 MYBPC3Q14896 1274 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 TTC38Q5R3I4 469 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 HIPK4Q8NE63 616 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 HPS3Q969F9 1004 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 FERMT2Q96AC1 680 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 CCDC120Q96HB5 630 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 RAX2Q96IS3 184 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 RNF38Q9H0F5 515 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 WNT8AQ9H1J5 351 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 BTBD7Q9P203 1132 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM50BQ9Y247 325 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 WNK3Q9BYP7 1800 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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PRPF4B-204ENST00000466185 A6NNZ2 444 aa7.36□□□□□ -1.23
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PRPF4B-204ENST00000466185 HPXP02790 462 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 MYBP10242 640 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 PHKG2P15735 406 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 PNLIPP16233 465 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 AOAHP28039 575 aa7.36□□□□□ -1.23
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PRPF4B-204ENST00000466185 USP14P54578 494 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 MUM1Q2TAK8 710 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 PPM1NQ8N819 430 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.36□□□□□ -1.23
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PRPF4B-204ENST00000466185 E2F7Q96AV8 911 aa7.36□□□□□ -1.23
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PRPF4B-204ENST00000466185 PEX11GQ96HA9 241 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 MAML3Q96JK9 1138 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.36□□□□□ -1.23
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PRPF4B-204ENST00000466185 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 GPR160Q9UJ42 338 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 RGPD2P0DJD1 1756 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 RGS12O14924 1447 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 TNS2Q63HR2 1409 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 MSTNO14793 375 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 PRLP01236 227 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 PROCP04070 461 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 CYBBP04839 570 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 HMOX1P09601 288 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 FUT4P22083 530 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 MC4RP32245 332 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 ARL4AP40617 200 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 GALK1P51570 392 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC5A3P53794 718 aa7.35□□□□□ -1.23
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