RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM58Q8NG06 486 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 KATNBL1Q9H079 304 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 NAGPAQ9UK23 515 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 INTUQ9ULD6 942 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SNX12Q9UMY4 172 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PPME1Q9Y570 386 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 EMSYQ7Z589 1322 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 DENND3A2RUS2 1198 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 AKR1B10O60218 316 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 EVI5O60447 810 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 EXOC3O60645 756 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MOCS3O95396 460 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D8O95759 1140 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FERP16591 822 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CHRNB2P17787 502 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CNGA1P29973 690 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GTF2H1P32780 548 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SOX5P35711 763 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 RFC5P40937 340 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 NAMPTP43490 491 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GPC3P51654 580 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRC-210ENST00000462363 CYP24A1Q07973 514 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SPA17Q15506 151 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 WDR93Q6P2C0 686 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRC-210ENST00000462363 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MNS1Q8NEH6 495 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 HELQQ8TDG4 1101 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SHC3Q92529 594 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 UBXN4Q92575 508 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRC-210ENST00000462363 SEMA4DQ92854 862 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 OPTNQ96CV9 577 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CEP170P1Q96L14 293 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRC-210ENST00000462363 MMS19Q96T76 1030 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GPR20Q99678 358 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRC-210ENST00000462363 EPC1Q9H2F5 836 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF302Q9NR11 478 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRC-210ENST00000462363 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SAMM50Q9Y512 469 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 EVPLQ92817 2033 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0B4J269 797 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC151A5D8V7 595 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.13□□□□□ -1.43
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