RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451997.5

SH3BP1-203, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 3,123 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-203ENST00000451997 AP1G2O75843 785 aa13.56□□□□□ -0.24
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SH3BP1-203ENST00000451997 TBC1D16Q8TBP0 767 aa13.56□□□□□ -0.24
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SH3BP1-203ENST00000451997 ZSWIM1Q9BR11 485 aa13.55□□□□□ -0.24
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SH3BP1-203ENST00000451997 CD209Q9NNX6 404 aa13.54□□□□□ -0.24
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SH3BP1-203ENST00000451997 PCK1P35558 622 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-203ENST00000451997 SEL1L2Q5TEA6 688 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-203ENST00000451997 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-203ENST00000451997 RNF207Q6ZRF8 634 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-203ENST00000451997 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-203ENST00000451997 APEX2Q9UBZ4 518 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-203ENST00000451997 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
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SH3BP1-203ENST00000451997 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa13.53□□□□□ -0.24
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