RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 RGS18Q9NS28 235 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 CHD9Q3L8U1 2897 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 EPOPA6NHQ4 379 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 RFXAPO00287 272 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 TSPAN1O60635 241 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 KINO60870 393 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 NR1I2O75469 434 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGEF15O94989 841 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 LIG1P18858 919 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 CUL4BQ13620 913 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 AMHR2Q16671 573 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 UNC13DQ70J99 1090 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC51Q96ER9 411 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 BLZF1Q9H2G9 400 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 CERS4Q9HA82 394 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 MYH11P35749 1972 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-205ENST00000450873 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 K7ENM7 598 aa11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 MGEA5O60502 916 aa11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 STRN3Q13033 797 aa11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 COASYQ13057 564 aa11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 AAK1Q2M2I8 961 aa11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 NOTUMQ6P988 496 aa11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC24A5Q71RS6 500 aa11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC01599Q8WXQ3 324 aa11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ARNTL2Q8WYA1 636 aa11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 LMBRD1Q9NUN5 540 aa11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PRDM4Q9UKN5 801 aa11.65□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 SKIP12755 728 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 CASP1P29466 404 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 DEFB103AP81534 67 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF720Q7Z2F6 126 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 FIZ1Q96SL8 496 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GUA9 196 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ESPNB1AK53 854 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 C9IYK1 514 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 N4BP3O15049 544 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 GJB5O95377 273 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 STAG3L1P0CL83 205 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 NMT1P30419 496 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM189BP81408 668 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 GTF2BQ00403 316 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ALCAMQ13740 583 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 POSTNQ15063 836 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TAS1R3Q7RTX0 852 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 MYOCDQ8IZQ8 938 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 HVCN1Q96D96 273 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 RAD9AQ99638 391 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 LMCD1Q9NZU5 365 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TBX20Q9UMR3 447 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 COG5Q9UP83 839 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0U1RQF3 1178 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 B4GALT5O43286 388 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 BMP1P13497 986 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB27AP51159 221 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 DPYDQ12882 1025 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PSMD2Q13200 908 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TOP1MTQ969P6 601 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 CPB2Q96IY4 423 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 EXOC1Q9NV70 894 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 TBC1D7Q9P0N9 293 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 MICAL3Q7RTP6 2002 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 LCHNA4D1U4 455 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 KLRC4O43908 158 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 LPXNO60711 386 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 PRR29P0C7W0 189 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-205ENST00000450873 EHHADHQ08426 723 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms