RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 ANO5Q75V66 913 aa17.28■□□□□ 0.36
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SHQ1-202ENST00000444040 MAP4K3Q8IVH8 894 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-202ENST00000444040 OR2W6PQ8NHA6 318 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-202ENST00000444040 SEMA4DQ92854 862 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-202ENST00000444040 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-202ENST00000444040 TRIM51Q9BSJ1 452 aa17.28■□□□□ 0.36
SHQ1-202ENST00000444040 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.28■□□□□ 0.36
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SHQ1-202ENST00000444040 NPTX2P47972 431 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-202ENST00000444040 CORO7P57737 925 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF844Q08AG5 666 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-202ENST00000444040 PPP2R5EQ16537 467 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-202ENST00000444040 RNF207Q6ZRF8 634 aa17.27■□□□□ 0.36
SHQ1-202ENST00000444040 GZMAP12544 262 aa17.27■□□□□ 0.35
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SHQ1-202ENST00000444040 COPB2P35606 906 aa17.27■□□□□ 0.35
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SHQ1-202ENST00000444040 PARD3BQ8TEW8 1205 aa17.27■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 SHC3Q92529 594 aa17.27■□□□□ 0.35
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SHQ1-202ENST00000444040 ACP6Q9NPH0 428 aa17.27■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 GINM1Q9NU53 330 aa17.27■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 COQ4Q9Y3A0 265 aa17.27■□□□□ 0.35
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SHQ1-202ENST00000444040 MTA2O94776 668 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
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SHQ1-202ENST00000444040 KIFC3Q9BVG8 833 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 EXOC7Q9UPT5 735 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 USP8P40818 1118 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 MTMR3Q13615 1198 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ARHGEF16Q5VV41 709 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 DUPD1Q68J44 220 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 AADACL2Q6P093 401 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 SLC47A2Q86VL8 602 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 PPM1KQ8N3J5 372 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 HVCN1Q96D96 273 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 SAAL1Q96ER3 474 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 WNK4Q96J92 1243 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 RPS6KC1Q96S38 1066 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 RIPK3Q9Y572 518 aa17.26■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 MYO1FO00160 1098 aa17.25■□□□□ 0.35
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SHQ1-202ENST00000444040 CYP26A1O43174 497 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ZBED4O75132 1171 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 MYZAPP0CAP1 466 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 MARCKSL1P49006 195 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 PEX5P50542 639 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 DR1Q01658 176 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 GUCY1A3Q02108 690 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 CLUL1Q15846 466 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 KRT39Q6A163 491 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 SLC39A4Q6P5W5 647 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 NSMFQ6X4W1 530 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 HELQQ8TDG4 1101 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 BSNDQ8WZ55 320 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ZSWIM1Q9BR11 485 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 TXLNGYQ9BZA5 131 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 RAB17Q9H0T7 212 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 RASSF4Q9H2L5 321 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 159.4
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SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC169A6NNP5 214 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD65E5RJM6 399 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ZEB2O60315 1214 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 LSP1P33241 339 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 SMTNP53814 917 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 FMO1Q01740 532 aa17.25■□□□□ 0.35
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SHQ1-202ENST00000444040 FBXL18Q96ME1 805 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 SENP7Q9BQF6 1050 aa17.25■□□□□ 0.35
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SHQ1-202ENST00000444040 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 PNMA2Q9UL42 364 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 DENND3A2RUS2 1198 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA6L10A6NI86 522 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 MMEP08473 750 aa17.25■□□□□ 0.35
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SHQ1-202ENST00000444040 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 TNFAIP1Q13829 316 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 GLG1Q92896 1179 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 CD101Q93033 1021 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC127Q96BQ5 260 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ATG4CQ96DT6 458 aa17.25■□□□□ 0.35
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM8AQ9HCN3 771 aa17.25■□□□□ 0.35
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