RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 PPP2R5EQ16537 467 aa14.79□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.79□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 RNF181Q9P0P0 153 aa14.79□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.79□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.79□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.78□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 FAM81BQ96LP2 452 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 SH3GL2Q99962 352 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 THAP2Q9H0W7 228 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 ISCUQ9H1K1 167 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 CARD9Q9H257 536 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.78□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.78□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 ACTN2P35609 894 aa14.78□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 GZMAP12544 262 aa14.77□□□□□ -0.05
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THBS3-202ENST00000428962 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.77□□□□□ -0.05
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THBS3-202ENST00000428962 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ESYT3A0FGR9 886 aa14.76□□□□□ -0.05
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THBS3-202ENST00000428962 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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THBS3-202ENST00000428962 RPS6KA5O75582 802 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 STBD1O95210 358 aa14.76□□□□□ -0.05
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THBS3-202ENST00000428962 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 CYP24A1Q07973 514 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ZSCAN26Q16670 478 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 PTPROQ16827 1216 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 XKR3Q5GH77 459 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 CFAP58Q5T655 872 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 GPD1LQ8N335 351 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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