RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC19Q9H756 370 aa18.14■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa18.14■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 RGL1Q9NZL6 768 aa18.14■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 GTF3C4Q9UKN8 822 aa18.14■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 PRR12Q9ULL5 1215 aa18.14■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa18.14■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 RPTORQ8N122 1335 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1B0GUA9 196 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 F8W031 263 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 G3V3G9 751 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 CAND2O75155 1236 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 TCEA3O75764 348 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 CYP1A2P05177 515 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 POTEJP0CG39 1038 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 ABCB4P21439 1286 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 STAT2P52630 851 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 KCNA1Q09470 495 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 DCAF8Q5TAQ9 597 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 SMYD5Q6GMV2 418 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 TPH2Q8IWU9 490 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 SYCP3Q8IZU3 236 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 SAMD3Q8N6K7 520 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 SERPINB12Q96P63 405 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 FAM198AQ9UFP1 575 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 COG5Q9UP83 839 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 MGRN1O60291 552 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 CHN1P15882 459 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 PDE6CP51160 858 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 SCNN1DP51172 638 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 VAMP7P51809 220 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 IKQ13123 557 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 TNIP1Q15025 636 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 QPCTQ16769 361 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 FAM160B2Q86V87 743 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 FAM71AQ8IYT1 594 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 FBXO25Q8TCJ0 367 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 WDR18Q9BV38 432 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 GOPCQ9HD26 462 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 PNMA2Q9UL42 364 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 SLC12A4Q9UP95 1085 aa18.13■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 RIMBP2O15034 1052 aa18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 PPIP5K2O43314 1243 aa18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 FTLP02792 175 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 COILP38432 576 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 CYP2J2P51589 502 aa18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 PLTPP55058 493 aa18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 CALCOCO2Q13137 446 aa18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF568Q3ZCX4 644 aa18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 USH1GQ495M9 461 aa18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 USP37Q86T82 979 aa18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 GRK7Q8WTQ7 553 aa18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 FOXP3Q9BZS1 431 aa18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 ERVK-5Q9HDB9 667 aa18.12■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 O00370 1275 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 DNM1LO00429 736 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 RASGRF2O14827 1237 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 RIPK2O43353 540 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 EZRP15311 586 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 GTF2H1P32780 548 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 PDE6BP35913 854 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 MFAP3P55082 362 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 XXYLT1Q8NBI6 393 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 BBOF1Q8ND07 529 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 PIGOQ8TEQ8 1089 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM11Q96F44 468 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 ADAM7Q9H2U9 754 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 STK32BQ9NY57 414 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 EXOC7Q9UPT5 735 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 SNX24Q9Y343 169 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 NR2E1Q9Y466 385 aa18.11■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 ECEL1O95672 775 aa18.1■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM49P0CI25 452 aa18.1■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM49CP0CI26 452 aa18.1■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 ITIH2P19823 946 aa18.1■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 RPL21P46778 160 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 RWDD2BP57060 319 aa18.1■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 GHRHRQ02643 423 aa18.1■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa18.1■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 SHC3Q92529 594 aa18.1■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 KIFAP3Q92845 792 aa18.1■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF577Q9BSK1 485 aa18.1■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
HCLS1-202ENST00000428394 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms