RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TGFB1I1O43294 461 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 CCNE1P24864 410 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 AXLP30530 894 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 RFC2P35250 354 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF445P59923 1031 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 GPNMBQ14956 572 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 MFSD5Q6N075 450 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 NOTUMQ6P988 496 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM199Q8N511 208 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TSG101Q99816 390 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TCHPQ9BT92 498 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 BICDL2A1A5D9 508 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 PDXKO00764 312 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TOM1L1O75674 476 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 SYN1P17600 705 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 CENPPQ6IPU0 288 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 N4BP3O15049 544 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 SEPT8Q92599 483 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TSPY26PQ9H489 355 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 CITO14578 2027 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1B0GUA9 196 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 CLIC2O15247 247 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 CLDN3O15551 220 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 CXCL10P02778 98 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 CSF2RAP15509 400 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC63Q05C16 580 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB33Q86T24 672 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 APBB2Q92870 758 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC51Q96ER9 411 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TMX1Q9H3N1 280 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 CHST12Q9NRB3 414 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 NR3C1P04150 777 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 PROZP22891 400 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ADSSP30520 456 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TTI2Q6NXR4 508 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 BADQ92934 168 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TRIP11Q15643 1979 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 GARTP22102 1010 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 NR2F2P24468 414 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF165P49910 485 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 CYP2J2P51589 502 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 CDT1Q9H211 546 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 ABLIM1O14639 778 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 MGEA5O60502 916 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 NPTXRO95502 500 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 CAVIN2O95810 425 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 MCL1Q07820 350 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 MED15Q96RN5 788 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA4-202ENST00000428284 ADAM2Q99965 735 aa22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms