RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRR16Q569H4 304 aa18.59■□□□□ 0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PARM1Q6UWI2 310 aa18.59■□□□□ 0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.59■□□□□ 0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHPN2Q8IUC4 686 aa18.59■□□□□ 0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLDN23Q96B33 292 aa18.59■□□□□ 0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PARD6AQ9NPB6 346 aa18.59■□□□□ 0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa18.59■□□□□ 0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FNIP2Q9P278 1114 aa18.59■□□□□ 0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 V9GY48 417 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PATJQ8NI35 1801 aa18.58■□□□□ 0.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZMYND10O75800 440 aa18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFEMP2O95967 443 aa18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHMLP26374 656 aa18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR1G1P47890 313 aa18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JAK3P52333 1124 aa18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NRLP54845 237 aa18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DMWDQ09019 674 aa18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAIR1Q6GTX8 287 aa18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LILRA6Q6PI73 481 aa18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNNM3Q8NE01 707 aa18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHST7Q9NS84 486 aa18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SGSM2O43147 1006 aa18.57■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP2R5DQ14738 602 aa18.57■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UGCGQ16739 394 aa18.57■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTERF2Q49AM1 385 aa18.57■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XKR3Q5GH77 459 aa18.57■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COLGALT2Q8IYK4 626 aa18.57■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIT2Q99578 217 aa18.57■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BAHCC1Q9P281 2608 aa18.56■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CIITAP33076 1130 aa18.56■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPEM2Q0P670 501 aa18.56■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP41Q3LFD5 358 aa18.56■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTC22Q5TAA0 569 aa18.56■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLRP4Q96MN2 994 aa18.56■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COLEC11Q9BWP8 271 aa18.56■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa18.56■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GAS7O60861 476 aa18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RETP07949 1114 aa18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD72P21854 359 aa18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FUT2Q10981 343 aa18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RTN1Q16799 776 aa18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APOA5Q6Q788 366 aa18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSSK4Q6SA08 328 aa18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF852Q6ZMS4 543 aa18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RDM1Q8NG50 284 aa18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FGF13Q92913 245 aa18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MBOAT7Q96N66 472 aa18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP89Q96ST8 783 aa18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHF20Q9BVI0 1012 aa18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ESYT2A0FGR8 921 aa18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHMP2AO43633 222 aa18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAFO75444 373 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITGA4P13612 1032 aa18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TARSP26639 723 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DSC1Q08554 894 aa18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LENG9Q96B70 501 aa18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TEKT3Q9BXF9 490 aa18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFT122Q9HBG6 1241 aa18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C6orf50Q9HD87 102 aa18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHDP01880 384 aa18.53■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADCY1Q08828 1119 aa18.53■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LIN9Q5TKA1 542 aa18.53■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.53■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.53■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLYCTKQ8IVS8 523 aa18.53■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KSR1Q8IVT5 923 aa18.53■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IER2Q9BTL4 223 aa18.53■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.53■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZMYND12Q9H0C1 365 aa18.53■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYH15Q9Y2K3 1946 aa18.53■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARL5CA6NH57 179 aa18.52■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MSH4O15457 936 aa18.52■□□□□ 0.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XYLBO75191 536 aa18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms