RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411265.1

RNU6-1001P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1001, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1001P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HK1P19367 917 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CASRP41180 1078 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DPTQ07507 201 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 STRN3Q13033 797 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM214AQ32MH5 1076 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PITRM1Q5JRX3 1037 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 THNSL2Q86YJ6 484 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF276Q8N554 614 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF480Q8WV37 535 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CLIP3Q96DZ5 547 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RAX2Q96IS3 184 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRRX2Q99811 253 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ENKD1Q9H0I2 346 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KCTD10Q9H3F6 313 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMX1Q9H3N1 280 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 XDHP47989 1333 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM191CA6NGB0 347 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NEMP1O14524 444 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM20BO75063 409 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM127O75204 238 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 STC2O76061 302 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GASTP01350 101 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MTHFD2P13995 350 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ENPP1P22413 925 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MGAT1P26572 445 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAPQ12884 760 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 UGT8Q16880 541 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FNDC7Q5VTL7 733 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C1QL3Q5VWW1 255 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SDE2Q6IQ49 451 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM180AQ6UWF9 173 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LRRC55Q6ZSA7 311 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MRGPRGQ86SM5 289 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CLRN3Q8NCR9 226 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR52N2Q8NGI0 321 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SNX33Q8WV41 574 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HAS1Q92839 578 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRPS1Q9UHF7 1281 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SORCS3Q9UPU3 1222 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 A0A087X1B8 175 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ITGA10O75578 1167 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RPS6KA4O75676 772 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ABHD16AO95870 558 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LPLP06858 475 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CRHR1P34998 444 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LGALS4P56470 323 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC25A3Q00325 362 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 UBE3CQ15386 1083 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 VPS72Q15906 364 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C19orf54Q5BKX5 351 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CT83Q5H943 113 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CRB2Q5IJ48 1285 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KCNV1Q6PIU1 500 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LYSMD2Q8IV50 215 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CPT1CQ8TCG5 803 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AUTS2Q8WXX7 1259 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LENG9Q96B70 501 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CHFRQ96EP1 664 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CEP89Q96ST8 783 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MENTQ9BUN1 341 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GPRC5DQ9NZD1 345 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRKAB1Q9Y478 270 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GAGE12BA1L429 117 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GAGE12HA6NDE8 117 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GRXCR1A8MXD5 290 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DIRC3C9JPN6 131 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RAMP2O60895 175 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ITGB1P05556 798 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SPATA31D3P0C874 917 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LAG3P18627 525 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CNGA1P29973 690 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 INHBEP58166 350 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMPRSS15P98073 1019 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 APBA1Q02410 837 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PDCD1Q15116 288 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PTPAQ15257 358 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MST1LQ2TV78 715 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms