RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 BNC1Q01954 994 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLC12A1Q13621 1099 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 AMIGO3Q86WK7 504 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 SYNE4Q8N205 404 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMEM87AQ8NBN3 555 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TTC17Q96AE7 1141 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TINF2Q9BSI4 451 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 USE1Q9NZ43 259 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TSPOAP1O95153 1857 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 KMT2EQ8IZD2 1858 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 VWA5AO00534 786 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TNFRSF21O75509 655 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 HSPA4LO95757 839 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ABL2P42684 1182 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARFIP2P53365 341 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 WLSQ5T9L3 541 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 NAA35Q5VZE5 725 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM45BPQ6NSW5 357 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CHST3Q7LGC8 479 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC127Q96BQ5 260 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CPDO75976 1380 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 DIP2AQ14689 1571 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 A0A1W2PRG6 482 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CALB1P05937 261 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 IGBP1P78318 339 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TCEANC2Q96MN5 208 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CHID1Q9BWS9 393 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 IL25Q9H293 177 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 SAC3D1A6NKF1 404 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 B4DLN1 442 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ASAP2O43150 1006 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PSTPIP1O43586 416 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PAX3P23760 479 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PMS2P54278 862 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF174Q15697 407 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 IYDQ6PHW0 289 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM178BQ8IXR5 827 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 BPIFA3Q9BQP9 254 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PAG1Q9NWQ8 432 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PLCL2Q9UPR0 1127 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 KLHL18O94889 574 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATP2B4P23634 1241 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 HOXC8P31273 242 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 LGALS3BPQ08380 585 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ADCY1Q08828 1119 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARMC4Q5T2S8 1044 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 FGD2Q7Z6J4 655 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 VPS50Q96JG6 964 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 KCNK16Q96T55 309 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIM51Q9BSJ1 452 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TELO2Q9Y4R8 837 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TOM1O60784 492 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ALBP02768 609 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 IL6P05231 212 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ACAP2Q15057 778 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 AGBL2Q5U5Z8 902 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARHGAP17Q68EM7 881 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRT74Q7RTS7 529 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 POLNQ7Z5Q5 900 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 UBASH3BQ8TF42 649 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 RNF34Q969K3 372 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 SNF8Q96H20 258 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ABHD8Q96I13 439 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PLIN2Q99541 437 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 EDEM3Q9BZQ6 932 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 DCTPP1Q9H773 170 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF556Q9HAH1 456 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 TNS3Q68CZ2 1445 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPLO60437 1756 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 SNTNA6NMZ2 147 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 CENPXA8MT69 81 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 EVPLLA8MZ36 301 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 H7C0S8 307 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 AKAP10O43572 662 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRT37O76014 449 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 MOCS3O95396 460 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 EPHB1P54762 984 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRZ1-201ENST00000393386 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms