RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 CITO14578 2027 aa18.05■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 ACKR2O00590 384 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 LINC01565O15544 149 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 HIP1RO75146 1068 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 GALTP07902 379 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNA5P22460 613 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 LONP1P36776 959 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC11A1P49279 550 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP2R5AQ15172 486 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARSHQ5FYA8 562 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 NT5DC1Q5TFE4 455 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 VN1R2Q8NFZ6 395 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNN1Q92952 543 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 MSLNLQ96KJ4 702 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 NT5C3AQ9H0P0 336 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP20Q9Y2K6 914 aa18.04■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARL5CA6NH57 179 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 NCK2O43639 380 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 STX6O43752 255 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRKCBP05771 671 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 NPTX2P47972 431 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 EEF1DP3Q658K8 133 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP49Q70CQ1 688 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 CABP7Q86V35 215 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 EFHBQ8N7U6 833 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 IGSF21Q96ID5 467 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZFP42Q96MM3 310 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP28Q96RU2 1077 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 TIPINQ9BVW5 301 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCSER1Q9C0I3 900 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLEC1BQ9P126 229 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa18.03■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 HIDE1A8MVS5 230 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABLIM1O14639 778 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 CSPG5O95196 566 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 NPTXRO95502 500 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLA2G4BP0C869 781 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 ITGA4P13612 1032 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 DUSP6Q16828 381 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 COLGALT2Q8IYK4 626 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 GAD1Q99259 594 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLIN2Q99541 437 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZBP1Q9H171 429 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 CXCL16Q9H2A7 254 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTPRHQ9HD43 1115 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBN1Q9NPG3 1134 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 MARCH5Q9NX47 278 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 GIT1Q9Y2X7 761 aa18.02■□□□□ 0.48
NME1-NME2-202ENST00000393193 VWA8A3KMH1 1905 aa18.02■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 GRXCR2A6NFK2 248 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 H3BQ06 376 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 MLH1P40692 756 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 NRIP1P48552 1158 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 NASPP49321 788 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 EFNA5P52803 228 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 KARSQ15046 597 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 NAB2Q15742 525 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAPK6Q16659 721 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 DEPTORQ8TB45 409 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM175Q9BSA9 504 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM134Q9H6X4 195 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLDND1Q9NY35 253 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCND2Q9NZV8 630 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 KANSL3Q9P2N6 904 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 IRAK3Q9Y616 596 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLXNA3P51805 1871 aa18.01■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 CARNS1A5YM72 827 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 N4BP3O15049 544 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 POMCP01189 267 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 IL9P15248 144 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLCG1P19174 1290 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 PROZP22891 400 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 SCNN1GP51170 649 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF131P52739 623 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 PEX3P56589 373 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC39A14Q15043 492 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 URGCPQ8TCY9 931 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPIRE2Q8WWL2 714 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 IFT74Q96LB3 600 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 DRC1Q96MC2 740 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 TCF25Q9BQ70 676 aa18■□□□□ 0.47
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms