RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 ACKR2O00590 384 aa22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 B4GALT3O60512 393 aa22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 TBX10O75333 385 aa22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 DDHD2O94830 711 aa22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 HACE1Q8IYU2 909 aa22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 IGSF21Q96ID5 467 aa22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.74■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC26A4O43511 780 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 PRKCBP05771 671 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 IL9P15248 144 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 EFNA5P52803 228 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 TMC7Q7Z402 723 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 DAW1Q8N136 415 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 GAD1Q99259 594 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 GBP3Q9H0R5 595 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 FSD2A1L4K1 749 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 ARL5CA6NH57 179 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 PER2O15055 1255 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 NPTXRO95502 500 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 POMCP01189 267 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 MLH1P40692 756 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC11A1P49279 550 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 RESTQ13127 1097 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 DUSP6Q16828 381 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 CABP7Q86V35 215 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 TIPINQ9BVW5 301 aa22.72■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 HIDE1A8MVS5 230 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 N4BP3O15049 544 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 HIP1RO75146 1068 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 GLP2RO95838 553 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 ALDH2P05091 517 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 EDN1P05305 212 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 GUCY2CP25092 1073 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 NDUFV1P49821 464 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 MAPK7Q13164 816 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 DRC1Q96MC2 740 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 PLIN2Q99541 437 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 APOL6Q9BWW8 343 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 MIOSQ9NXC5 875 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 CLEC1BQ9P126 229 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM50BQ9Y247 325 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 MYH11P35749 1972 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2E3-201ENST00000392415 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 UBA7P41226 1012 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 NPTX2P47972 431 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC12A3P55017 1021 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 PEX3P56589 373 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 VPS52Q8N1B4 723 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFP42Q96MM3 310 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 MTMR6Q9Y217 621 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 USP20Q9Y2K6 914 aa22.7■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 K7ERI5 159 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 NRP1O14786 923 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 MBTPS2O43462 519 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 PLA2G4BP0C869 781 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 LIG1P18858 919 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 AKAP5P24588 427 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 SCNN1GP51170 649 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 GRIN1Q05586 938 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 DSC1Q08554 894 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNC3Q14003 757 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPAQ15257 358 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 CALML4Q96GE6 196 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBP1Q9H171 429 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 KCND2Q9NZV8 630 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-201ENST00000392415 CD207Q9UJ71 328 aa22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms