RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPPL3Q8TCT6 385 aa24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-20-201ENST00000390606 LMAN2LQ9H0V9 348 aa24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-20-201ENST00000390606 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-20-201ENST00000390606 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-20-201ENST00000390606 AAASQ9NRG9 546 aa24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-20-201ENST00000390606 RCOR1Q9UKL0 485 aa24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-20-201ENST00000390606 CFAP45Q9UL16 551 aa24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-20-201ENST00000390606 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-20-201ENST00000390606 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRANK1O15050 2925 aa24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-20-201ENST00000390606 N4BP3O15049 544 aa24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC16A4O15374 487 aa24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 ITGA4P13612 1032 aa24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF131P52739 623 aa24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 PTPROQ16827 1216 aa24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 SHC4Q6S5L8 630 aa24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 PANK2Q9BZ23 570 aa24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D13Q9NVG8 400 aa24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 EYSQ5T1H1 3165 aa24.25■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYO7AQ13402 2215 aa24.25■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 INPPL1O15357 1258 aa24.25■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAJB1P25685 340 aa24.25■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNT2Q6UVM3 1135 aa24.25■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 UBN1Q9NPG3 1134 aa24.25■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRDM6Q9NQX0 595 aa24.25■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.25■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.25■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 PBX3P40426 434 aa24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNN1Q92952 543 aa24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF558Q96NG5 402 aa24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 GAD1Q99259 594 aa24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYH11P35749 1972 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 B4GALT3O60512 393 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 FGF18O76093 207 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM13AO94988 1023 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 STAT6P42226 847 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMTNP53814 917 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 NCKAP1LP55160 1127 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 THNSL1Q8IYQ7 743 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 PDILTQ8N807 584 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 POF1BQ8WVV4 589 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 APOL6Q9BWW8 343 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 PARVGQ9HBI0 331 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARL5CA6NH57 179 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYMKA6NI61 221 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 KRT18P05783 430 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 AKAP5P24588 427 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 MLH1P40692 756 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 BCAR1P56945 870 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 E2F4Q16254 413 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 TIGD5Q53EQ6 642 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 SV2BQ7L1I2 683 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF280BQ86YH2 543 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 HACE1Q8IYU2 909 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC39A11Q8N1S5 342 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 URGCPQ8TCY9 931 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 FIZ1Q96SL8 496 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 MIOSQ9NXC5 875 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 KANSL3Q9P2N6 904 aa24.22■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 DDHD2O94830 711 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 ME1P48163 572 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLCB3Q01970 1234 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 UBE3AQ05086 875 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 DYMQ7RTS9 669 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYCT1Q8N699 235 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 GSTCDQ8NEC7 633 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 DDX12PQ92771 950 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAJC19Q96DA6 116 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZFP42Q96MM3 310 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa24.21■■□□□ 1.47
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 ABLIM1O14639 778 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBCAO75347 108 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 POMCP01189 267 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 GALTP07902 379 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 PROZP22891 400 aa24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-20-201ENST00000390606 IRS1P35568 1242 aa24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms