RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 CDR2Q01850 454 aa15.2■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.2■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 FBXW10Q5XX13 1052 aa15.2■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 C1orf228Q6PIY5 440 aa15.2■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 RHOT1Q8IXI2 618 aa15.2■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.2■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SHROOM2Q13796 1616 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CTDNEP1O95476 244 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 RASGRP2Q7LDG7 609 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIAA1586Q9HCI6 787 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 STOML1Q9UBI4 398 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM187AA6NFU0 413 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 TCP11X1B4DZS4 312 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SRGNP10124 158 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SCP2P22307 547 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 GALCP54803 685 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 RTKN2Q8IZC4 609 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 C9orf72Q96LT7 481 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 LRFN2Q9ULH4 789 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PHF20L1A8MW92 1017 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARSEP51690 589 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC18A3Q16572 532 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 FBXL13Q8NEE6 735 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 AGPAT1Q99943 283 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCSER1Q9C0I3 900 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CAV1Q03135 178 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 NUDCD3Q8IVD9 361 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SNF8Q96H20 258 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 MYMKA6NI61 221 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SCN4BQ8IWT1 228 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PARP9Q8IXQ6 854 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 TTC25Q96NG3 672 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 MTRQ99707 1265 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 FEM1BQ9UK73 627 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 GLI2P10070 1586 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 GYPCP04921 128 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 RAD23BP54727 409 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF302Q9NR11 478 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CRB1P82279 1406 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 NT5C2P49902 561 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 GPC3P51654 580 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 COPS2P61201 443 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 NR1H3Q13133 447 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SEL1LQ9UBV2 794 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC9A1P19634 815 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 RFX1P22670 979 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 RNF135Q8IUD6 432 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 RNF217Q8TC41 542 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CHEK2O96017 543 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CDH6P55285 790 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 LDHDQ86WU2 507 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 MDH1P40925 334 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 FRMD5Q7Z6J6 570 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCT8L2Q96SF2 557 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 FSD1LQ9BXM9 530 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 KLC4Q9NSK0 619 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 STRIP2Q9ULQ0 834 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 UCHL3P15374 230 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 PSMC5P62195 406 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 LONRF1Q17RB8 773 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS6KC1-201ENST00000366959 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms